バイオイメージングセンター(BIC)について

 日本女子大学バイオイメージングセンター(BIC)は、2014年度文部科学省私立大学戦略的研究基盤形成支援事業の採択を受け、5年間にわたり「生命動作原理を解き明かす新バイオイメージング技術の開発とその応用」というプロジェクトを推進した。BICの設立は、2001年度文部科学省私立大学高度化推進事業に採択されたことに端を発する。当時はオープン・リサーチ・センター(ORC)という名称だったが、その後の色々の変遷を経つつも事業は継続した。ORC発足から数えて実に18年間の長きにわたったプロジェクトである。

概要
 生命科学分野では、個々の遺伝子機能や生体分子機能の解明において、細胞内微細構造や遺伝子の発現や機能タンパク質の局在等を知る顕微鏡学的手法が大変重要です。また、高分子、ナノ粒子や半導体などを扱う化学・物理分野においても、精製物や試料評価の判定に電子顕微鏡等を用いた物質解析法は欠かせません。近年、よく用いられる「バイオイメージング」という言葉は、狭義の意味では、蛍光顕微鏡及びその発展型装置を用いてタンパク質等の生体分子の分布や動態を画像化することです。しかし、バイオイメージングの言葉そのものの意味としては、電子顕微鏡や実体顕微鏡などの様々な顕微鏡ツールによるものも含まれるはずです。私達は、バイオイメージングを生物の画像化に関わるものという広い意味で捉え、新しい技術の開発と発信、先端的な基礎研究と応用研究に取り組んでいます。
 本プロジェクトではミクロからマクロに至る広範な事象を網羅し、あらゆるライフサイエンス分野からのニーズに応え、バイオイメージング拠点の形成を提案するものです。具体的には次の3つの目的を掲げています。

目的①:新世代のバイオイメージング技術の開発と発信
 光顕、電顕そして両者の橋渡しをする新しいバイオイメージング技術の開発を行い、次世代をリードするイメージング研究の高度化を実現する。外部機関との連携も重視して研究者の技術交流ネットワークを構築し、新技術の発信を行う。

目的➁:バイオイメージングを用いた先端的な基礎研究と応用研究
 分子・細胞・個体という生命の3つの階層を対象とした研究チームを備え、バイオイメージング技術を用いた先端的な基礎研究と実用化に向けた応用研究を展開する。ミクロからマクロに至る広範な事象を網羅し、あらゆるライフサイエンス分野からのニーズに応える。

目的➂:バイオイメージング技術者/研究者の次世代育成
様々な分野で望まれているバイオイメージング技術に秀でた新しい研究者・技術者を養成する。公共的に最先端技術の発信を行う他、多数のトレーニングコースを開講し、実地的な技術継承を行う。科学教室の開催や一般市民への理科啓発活動を行う。

 

沿革

本バイオイメージングセンターの前身は、2001年度に発足した日本女子大学オープン・リサーチ・センター(ORC)です。オープン・リサーチ・センターは、文部科学省私立大学高度化推進事業オープン・リサーチ・センター整備事業に採択されたことから、顕微鏡技術やその成果を外部にむけて(オープンに)発信することを目的として作られたセンターであり、およそ8年間の活動を行いました。その発展型として、2009年度に発足したのが日本女子大学バイオイメージングセンター(BIC)です。バイオイメージングセンターは2009~2013年度の文部科学省私立大学戦略的研究基盤形成支援事業の採択を受け、「バイオイメージングの基盤整備と高度化のための人材養成拠点」というプロジェクト名を掲げて誕生しました。このプロジェクトの主な目的はバイオイメージング技術に精通した人材(研究者・技術者)を養成することでした。2014年度からは「生命動作原理を解き明かす新バイオイメージング技術の開発とその応用」というプロジェクト名で採択され、2018年度をもって終了しました。

2001年度~2005年度(平成13年度~平成17年度) 
  私立大学学術研究高度化推進事業「オープン・リサーチ/センター整備事業」
1.酵母細胞の超微構造と機能に関する構造生物学的研究
2.植物細胞の超微構造と機能に関する構造生物学的研究
3.植物の構造多様性の総合的解析
4.細胞増殖/分化に伴う遺伝子発現シフトの分子細胞生物学的研究

2006年度~2008年度(平成18年度~平成20年度)  
  私立大学学術研究高度化推進事業「オープン・リサーチ/センター整備事業」
 バイオイメージングの基盤整理と高度化のための人材養成
1.ポストゲノム時代に応える生体機能分子イメージング研究
2.限界にいどむ細胞の超微構造イメージング研究
3.個体として捉えるミクロからマクロへのイメージング研究

2009年度~2013年度(平成21年度~平成25年度)
  私立大学戦略的研究基盤形成支援事業
 バイオイメージング研究の高度化に向けた人材養成拠点
1.ポストゲノム時代に応える生体機能分子イメージング研究
2.限界に挑戦する細胞の超微構造イメージング研究
3.個体の発生・分化メカニズムを解明するミクロからマクロへのイメージング研究
4.環境から生体へ取り込まれる外来性物質のイメージング研究

2014年度~2018年度(平成26年度~平成30年度)
  私立大学戦略的研究基盤形成支援事業
 生命動作原理を解き明かす新バイオイメージング技術の開発とその応用
1.光顕と電顕をつなぐ新しいバイオイメージング技術開発
2.バイオイメージングで紐解く分子・細胞・個体の生命動作原理

論文


 雑誌論文(2014年~2018年度まで、分頭の※は査読有) 

(所属・職名は2018年度時点のもの)


1.光顕と電顕をつなぐ新しいバイオイメージング技術開発

永田典子 (理学部・教授) 研究課題「新バイオイメージング技術の開発とオルガネラ分化の網羅的解析」

1)※Duan Z, Homma A, Kobayashi M, Nagata N, Kaneko Y, Fujiki Y, Nishida I : Photoassimilation, assimilate translocation and plasmodesmal biogenesis in the source leaves of Arabidopsis thaliana grown under an increased atmospheric CO2 concentration. Plant Cell Physiology, 55(2), 358–369, doi:10.1093/pcp/pcu004, (2014)

2)※Kurusu T, Koyano T, Hanamata S, Kubo T, Noguchi Y, Yagi C, Nagata N, Yamamoto T, Ohnishi T, Okazaki2Y, Kitahata N, Ando D, Ishikawa M, Wada S, Miyao A, Hirochika H, Shimada H, Makino A, Saito K, Ishida H, Kinoshita T, Kurata N, Kuchitsu K : OsATG7 is required for autophagy-dependent lipid metabolism in rice postmeiotic anther development. Autophagy, 10(5), 1-11, (2014)

3)※Tanoue R, Kobayashi M, Katayama K, Nagata N, Wada H : Phosphatidylglycerol biosynthesis is required for the development of embryos and normal membrane structures of chloroplasts and mitochondria in Arabidopsis. FEBS letters, 588(9), 1680-1685, http://dx.doi.org/10.1016/j.febslet.2014.03.010, (2014)

4)豊岡公徳,佐藤繭子,朽名夏麿,永田典子:高圧凍結技法を取り入れた広域透過電顕像自動取得システムの開発とその応用. Plant Morphology, 26, p3-8, (2014)

5)※Satou M, Enoki H, Oikawa A, Ohta D, Saito K, Hachiya T, Sakakibara H, Kusano M, Fukushima A, Saito K, Kobayashi M, Nagata N, Myouga F, Shinozaki K, Motohashi R : Integrated analysis of transcriptome and metabolome of Arabidopsis albino or pale green mutants with disrupted nuclear-encoded chloroplast proteins. Plant Molecular Biology, 85, 411-428, Doi: 10.1007/s11103-014-0194-9, (2014)

6)※Toyooka K, Sato M, Kutsuna N, Higaki T, Sawaki F, Wakazaki M, Goto Y, Hasezawa S, Nagata N, Matsuoka K : Wide-range High-Resolution Transmission Electron Microscopy Reveals Morphological and Distributional Changes of Endomembrane Compartments during Log-to-Stationary Transition of Growth Phase in Tobacco BY-2 Cells. Plant Cell Physiology, 55(9), 1544-1555, doi:10.1093/pcp/pcu084, (2014)

7)※Higaki T, Kato A, Myouga F, Kutsuna N, Hasezawa S, Nagata N : Automatic classification of chloroplast ultrastructure mutants with transmission electron microscopy. Bioimages, 22, 1-7, (2014)

8)※Higaki T, Kutsuna N, Akita K, Sato M, Wakazaki M, Goto Y, Sawaki F, Kobayashi M, Nagata N, Toyooka K, Hasezawa S : Semi-automatic organelle detection on transmission electron microscopic images. Scientific Reports, 5, 7794, 1-9, Doi: 10.1038/srep07794, (2015)

9)※Suzuki M, Takahashi S, Kondo T, Dohra H, Ito Y, Kiriiwa Y, Hayashi M, Kamiya S, Kato M, Fujiwara M, Fukao Y, Kobayashi M, Nagata N, Motohashi R: Plastid Proteomic Analysis in Tomato Fruit Development. PLOS ONE, Sep15;10(9), e0137266, doi: 10.1371/journal.pone.0137266, eCollection, (2015)

10)※Kuroiwa T, Ohnuma M, Imoto Y, Misumi O, Nagata N, Miyakawa I, Fujishima M, Yagisawa F, Kuroiwa H: Genome Size of the Ultrasmall Unicellular Freshwater Green Alga, Medakamo hakoo 311, as Determined by Staining with 4’,6-diamidino-2-phenylindole after Microwave Oven Treatments: II. Comparison with Cyanidioschyzon merolae, Saccharomyces cerevisiae (n, 2n), and Chlorella variabilis. Cytologia, 81(1), 69-76, Doi: 10.1508/cytologia.81.69, (2016)

11)※Okubo-Kurihara E, Ohtani M, Kurihara Y, Kakegawa K, Kobayashi M, Nagata N, Komatsu T, Kikuchi J, Cutler S, Demura T, Matsui M : Modification of plant cell wall structure accompanied by enhancement of saccharification efficiency using a chemical, lasalocid sodium. Scientific Reports, 6, 34602, doi:10.1038/srep34602, (2016)

12)※Akita K, Kobayashi M, Sato M, Kutsuna N, Ueda T, Toyooka K, Nagata N, Hasezawa S, Higaki T : Cell wall accumulation of fluorescent proteins derived from a trans-Golgi cisternal membrane marker and paramural bodies in interdigitated Arabidopsis leaf epidermal cells. Protoplasma, 254, 367-377, DOI 10.1007/s00709-016-0955-1, (2017)

13)※Kobayashi K, Kobayashi K, Yamaguchi H, Inoue YM, Takagi K, Fushihara K, Seki H, Suzuki M, Nagata N, Muranaka T: Platform for “Chemical Metabolic Switching” to increase sesquiterpene content in plants. Plant Biotechnology, 34, 65-69, DOI: 10.5511/plantbiotechnology.17.0114a, (2017)

14)※Kato S, Soshino M, Takaichi S, Ishikawa T, Nagata N, Asahina M, Shinomura T:Suppression of the phytoene synthase gene (EgcrtB) alters carotenoid content and intracellular structure of Euglena gracilis. BMC Plant Biology,17, 125, DOI 10.1186/s12870-017-1066-7, (2017)

15)※Fujii S, Kobayashi K, Nagata N, Masuda T, Wada H:Monogalactosyldiacylglycerol facilitates synthesis of photoactive protochlorophyllide in etioplasts. Plant Physiology, 174(4), 2183-2198, DOI: https://doi.org/10.1104/pp.17.00304, (2017)

16) 藤井祥,永田典子,増田建,和田元,小林康一:エチオプラストの発達と葉緑体への分化過程におけるガラクト脂質の役割. 光合成研究, 12月号解説記事, 139-147, (2018)

17)※Myouga F, Takahashi K, Tanaka R, Nagata N, Kiss A, Funk C, Nomura Y, Nakagami H, Jansson S, Shinozaki K:Stable accumulation of photosystem II requires ONE-HELIX PROTEIN1 (OHP1) of the light harvesting-like family. Plant Physiology, 176(3), 2277-2291, DOI: https://doi.org/10.1104/pp.17.01782, (2018)

18)※Fujii S, Kobayashi K, Nagata N, Masuda T, Wada H:Digalactosyldiacylglycerol is essential for organization of the membrane st¬ructure in etioplasts. Plant Physiology, 177, 1487-1497, DOI: https://doi.org/10.1104/pp.18.00227, (2018)

19)※Kobayashi K, Suzuki M, Muranaka T, Nagata N:The mevalonate pathway but not the methylerythritol phosphate pathway is critical for elaioplast and pollen coat development in Arabidopsis. Plant Biotechnology, 35(4), 381-385, https://doi.org/10.5511/plantbiotechnology.18.0702a, (2018)

20)※Moriyama T, Mori N, Nagata N, Sato N:Selective loss of photosystem I and formation of tubular thylakoids in heterotrophically grown red alga Cyanidioschyzon merolae. Photosynthesis Research, Published online: 10 November, https://doi.org/10.1007/s11120-018-0603-z, (2018)

21) H. Hamasaki, Y. Kurihara, T. Kuromori, H. Kusano, N. Nagata, Y. Yamamoto, H. Shimada, M. Matsui: SnRK1 kinase and the NAC transcription factor SOG1 are components of a novel signaling pathway mediating the low energy response triggered by depleted amounts of ATP. Frontiers Plant Science, 10, 503 (2019)

22)※Fujii S, Nagata N, Masuda T, Wada H, Kobayashi K:Galactolipids are essential for internal membrane transformation during etioplast-to- chloroplast differentiation. Plant Cell Physiology, in press,

23)※Kobayashi K, Suzuki M, Nagata N:Wax-deficient Arabidopsis mutant cer1-1 shows abnormal tapetosomes, elaioplasts, and pollen coat. Cytologia, in press,


小川賀代 (理学部・教授) 研究課題「Web情報公開システムの構築と画像自動認識・分類法の開発」

1) 小川賀代,ピトヨハルトノ: LMS蓄積データを用いた学習特徴の抽出における変数の粒度の検討.情報処理学会研究報告, 2014-CLE-13(4), 1-5, (2014)

2) 石川晶子,小川賀代,ピトヨハルトノ: 学習履歴データを活用した学習者の特性抽出手法の検討. 教育システム情報学会誌, 31(2), 185-196, (2014)

3)※Sakamoto M, Ogawa K: Optimization to reduce influence of the scintillation in optical wireless communication. Jpn. J. Appl. Phys., 53, 08MB12, doi:10.7567/JJAP.53.08MB12, (2014)

4)※Ogawa K, Saito A : Considerations for application of Laguerre-Gaussian beam wave in optical wireless communication. SPIE, 9202, 92121R, doi:10.1117/12.2062994, (2014)

5)※小川賀代:キャリア支援におけるポートフォリオ活用-持続可能なシステムに向けて-. 教育システム情報学会報, 32,27-36, (2015)

6) 岡田雅江,樋口政和,小室孝,小川賀代:携帯端末向け AR タイピングインタフェースのためのオプティカルフロー時系列を用いた入力動作識別. 映像情報メディア学会技術報告, 40(18), 51-55, (2016)

7) 齊藤彩,小川賀代:光無線通信システムにおけるラゲールガウスビームの適用の検討. 電子情報通信学会技術報告, 116(337), WBS2016-57, 53-57, (2016)

8)※Saito A,Tanabe A,Kurihara M,Hashimoto N, Ogawa K : Propagation properties of quantized Laguerre-Gaussian beams in atmospheric turbulence. SPIE, 9739, 973914, doi:10.1117/12.2212517, (2016)

9)※Hartono P, Ogawa K:Intuitive analysis by visualizing context relevant e-learning data. IPSJ Transaction computers and education, 3, 2, 20-27, (2017)

10)※Sakamoto A, Ogawa K:Investigation of mode demultiplexer for Laguerre-Gaussian mode multiplexing in free space. SPIE, Vol.10770, 1077011,(2018)


佐藤香枝 (理学部・教授) 研究課題「マイクロデバイス内における擬似組織空間の構築とその解析技術開発」

1)※Sasaki N, Jo J, Aoki I, Sato K : Magnetic Resonance Imaging of a Microvascular-Interstitium Model on a Microfluidic Device. Anal Biochem., 458, 72-4, (2014)

2)※Sato K Sasaki N, Svahn HA, Sato K : Microfluidics for nano-pathophysiology. Adv Drug Deliv Rev., 74, 115-21, (2014)

3)※Kuroda A, Ishigaki Y, Nilsson M, Sato K, Sato K : Microfluidics-based in situ padlock/rolling circle amplification system for counting single DNA molecules in a cell. Anal Sci., 30(12), 1107-12, (2014)

4)※Sasaki N, Maekawa C, Sato K: Alternating current cloud point extraction on a microchip: the effect of electrode geometry. Electrophoresis, 36(3), 424-427, (2015)

5)※Sato M, Sasaki N, Ato M, Hirakawa S, Sato K, Sato K : Microcirculation-on-a-chip: a microfluidic platform for assaying blood- and lymphatic-vessel permeability. PLoS ONE, 10(9), e0137301, (2015)

6)※Sato K: Microdevice in Cellular Pathology: Microfluidic Platforms for Fluorescence in situ Hybridization and Analysis of Circulating Tumor Cells. Anal Sci., 31(9), 867-73, (2015)

7)※佐藤香枝:マイクロ血管デバイスの構築. 化学工業, 67(4), 287-292, (2016)

8)※佐々木直樹,佐藤香枝:マイクロ血管モデルの構築と分析化学的応用. 分析化学, 65(5), 241-247, (2016)

9)※佐藤香枝,今泉幸子,森田金市:パーソナル吸光度計を用いた鉄イオンおよびタンパク質の定量分析. 分析化学, 65(9), 533-537, (2016)

10)※Sato K, Kikuchi S, Yoshida E, Ishii R, Sasaki N, Tsunoda K, Sato K: Patterned Co-culture of Live Cells on a Microchip by Photocrosslinking with Benzophenone. Anal Sci., 32(1), 113-6, (2016)

11)※Sato K, Nakajima M, Tokuda S, Ogawa A: Fluidic culture and analysis of pulmonary artery smooth muscle cells for study of pulmonary. Anal Sci., 32(11), 1217-1221, (2016)

12)※Sasaki N, Tatanou M, Suzuki T, Anraku Y, Kishimura A, Kataoka K, Sato K: A Membrane-Integrated Microfluidic Device to Study Permeation of Nanoparticles through Straight Micropores toward Rational Design of Nanomedicines. Anal Sci., 32, 1307-1314, (2016)

13)※Sasaki N, Gunji Y, Kase C, Sato K: Molecular crowding improves bead-based padlock rolling circle amplification. Anal Biochem, Feb 15, 519, 15-18, (2017)

14) 佐藤香枝:遺伝子転写量および遺伝子変異の細胞内蛍光検出技術. バイオインダストリー, 2017年4月号, 1-8, (2017)

15)※Izuta S, Yamaguchi S, Misawa R, Yamahira S, Tan M, Kawahara M, Suzuki T, Takagi T, Sato K, Nakamura M, Nagamune T, Okamoto A: Microfluidic preparation of anchored cell membrane sheets for in vitro analyses and manipulation of the cytoplasmic face. Sci Rep, 7(1), 14962, (2017)

16)Kamata E, Maeda M, Yanagisawa K, Sato K: Development of a cell culture microdevice with a detachable channel for clear observation. Lab Chip, Chips & Tips, 21 Feb 2018, (2018)「英国王立化学会のBlog形式の論文」

17)※Sato K, Sato K: Recent progress in the development of microfluidic vascular models. Anal Sci, 34(7), 755-764, (2018)

18)※Sato K, Kodama A, Kase C, Hirakawa S, Ato M: Development of a simple permeability assay method for snake venom-induced vascular damage. Anal Sci, 34(3), 323-327, (2018)

19)※Ishigaki Y, Sato K: Effects of microchannel shape and ultrasonic mixing on microfluidic padlock probe rolling circle amplification (RCA) reactions. Micromachines, 9(6), 272-282, (2018).

20)※Tanaka HY, Kitahara K, Sasaki N, Nakao N, Sato K, Narita H, Shimoda H, Matsusaki M, Nishihara H, Masamune A, Kano MR: Pancreatic stellate cells derived from human pancreatic cancer demonstrate aberrant SPARC-dependent ECM remodeling in 3D engineered fibrotic tissue of clinically relevant thickness. Biomaterials, 192, 355-367, (2019)

21)※Sato K, Sato M, Yokoyama M, Hirai M, Furuta A: Influence of culture conditions on cell proliferation in a microfluidic channel. Anal Sci, 35(1), 49-56, (2019)

22)※Sato K, Nitta M, Ogawa A: A microfluidic cell stretch device to investigate the effects of stretching stress on artery smooth muscle cell proliferation in pulmonary arterial hypertension. Inventions, 4 (1), 1, (2019)


鈴木智子 (理学部・助教) 研究課題「新規電顕技術開発と細胞間分子挙動の解析手法の確立」

1)※Ishihara H, Hashimoto H, Taketa E, Suzuki T, Mandai K, Kunoh H, Takada J:Silicon-rich, iron oxide microtubular sheath produced by an iron-oxidizing bacterium, Leptothrix sp. strain OUMS1, in culture. Minerals, 4, 565-577, (2014)

2)※Hashimoto H, Kobayashi G, Sakuma R, Fujii T, Hayashi N, Suzuki T, Kanno R, Takano M, Takada J:Bacterial nanometric amorphous Fe-based oxide: A potential lithium-ion battery anode material. Applied Materials and Interfaces, 6, 5374-5378, (2014)

3)※Taguchi F, Inoue Y, Suzuki T, Inagaki Y, Yamamoto M, Toyoda K, Noutoshi Y, Shiraishi T, Ichinose Y:Characterization of quorum sensing-controlled transcriptional regulator MarR and Rieske (2Fe-2S) cluster-containing protein (Orf5) that are involved in resistance to environmental stresses in Pseudomonas syringae pv. tabaci 6605. Molecular Plant Pathology, 16(4), 376-387, (2015)

4)※Kunoh T, Suzuki T, Shiraishi T, Kunoh H, Takada J:Treatment of Leptothrix cells with ultrapure water poses a threat to their viability. Biology, 4, 50-66, (2015)

5)※Suzuki T, Kunoh T, Nakatsuka D, Hashimoto H, Tamura K, Kunoh H, Takada J:Use of iron powder to obtain high yields of Leptothrix Sheaths in culture. Minerals, 5(2), 335-345, (2015)

6)※Sasaki N, Tatanou M, Suzuki T, Anraku Y, Kishimura A, Kataoka K, Sato K: A membrane-integrated microfluidic device to study permeation of nanoparticles through straight micropores toward rational design of nanomedicines. Analytical Sciences, 32, 1307-1314, (2016)

7)※Takada J, Hashimoto H, Suzuki T, Kunoh H: Biological and physicochemical characters and functions of amorphous iron oxides produced by iron-oxidizing bacteria at ambient temperature in hydrosphere. Journal of the Japan Society of Powder Metallurgy, 63(10), 869-875, (2016)

8)※Kunoh T, Hashimoto H, Suzuki T, Hayashi N, Tamura K, Takano M, Kunoh H, Takada J: Direct adherence of Fe(III) particles onto sheaths of Leptothrix sp. strain OUMS1 in culture. Minerals, 6(1), 4; doi:10.3390/min6010004., (2016)

9)※Kunoh T, Hashimoto H , I. R. McFarlane, Hayashi N, Suzuki T, Taketa E, Tamura K, Takano M, El-Naggar M Y, Kunoh H, Takada J: Abiotic deposition of Fe complexes onto Leptothrix sheaths. Biology 5(2), 26; doi:10.3390/biology5020026, (2016)

10)※Toyoda K, Yao S, Takagi M, Uchioki M, Miki M, Tanaka K, Suzuki T, Amano M, Kiba A, Kato T, Takahashi H, Ishiga Y, Matsui H, Noutoshi Y, Yamamoto M, Ichinose Y, Shiraishi T: The plant cell wall as a site for molecular contacts in fungal pathogenesis. Physiological and Molecular Plant Pathology, 95, 44-49, (2016)

11)※Suzuki T, Maeda A, Hirose M, Ichinose Y, Shiraishi T, Toyoda K: Ultrastructural and cytological studies on Mycosphaerella pinodes infection of the model legume Medicago truncatula. Frontiers in Plant Science. doi: 10.3389/fpls.2017.01132 (2017)

12)※Suzuki T, Murakami T, Takizumi Y, Ishimaru H, Kudo D, Takikawa Y, Matsuda Y, Kakutani K, Bai Y, Nonomura T: Trichomes: interaction sites of tomato leaves with biotrophic powdery mildew pathogens. European Journal of Plant Pathology. 150(1), 115-125,(2018)

13)※Suzuki T, Nishimura S, Yagi K, Nakamura R, Takikawa Y, Matsuda Y, Kakutani K, Nonomura K: Effects of light quality on conidiophore formation of the melon powdery mildew pathogen Podosphaera xanthii. Phytoparasitica, 46, 31-43, (2018)

14)※Kouzai Y, Kimura M, Watanabe M, Kusunoki K, Osaka D, Suzuki T, Matsui H, Yamamoto M, Ichinose Y, Toyoda K, Matsuura T, Mori IC, Hirayama T, Minami E, Nishizawa Y, Inoue K, Onda Y, Mochida K, Noutoshi Y: Salicylic acid-dependent immunity contributes to resistance against Rhizoctonia solani, a necrotrophic fungal agent of sheath blight, in rice and Brachypodium distachyon. New Phytol.,217(2), 771-783, (2018)


黒岩常祥 (理学研究科・客員教授) 研究課題「バイオイメージング技術とゲノム科学を用いて解明するオルガネラキネシスに基づく  真核生物の誕生と増殖の基本機構」

1)※Misonou Y, Kikuchi M, Sato H, Inai T, Kuroiwa T, Tanaka K, Miyakawa I:Aldehyde dehydrogenase, Ald4p, is a major component of mitochondrial fluorescent inclusion bodies in the yeast Saccharomyces cerevisiae. Biology Open, 3, 387-396, DOI: 10.1242/bio.20147138, (2014)

2)※Ohnuma M, Yokoyama T, Inouye T, Sekine Y, Kuroiwa T, Tanaka T : Optimization of polyethylene glycol (PEG)-mediated DNA introduction conditions for transient gene expression in the unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae. J. Gen. Appl. Microbiol., 60, 156-159, DOI:10.2323/jgam.60.156, (2014)

3)※Kobayashi Y, Harada N, Nishimura Y, Saito T, Nakamura M, Fujiwara T, Kuroiwa T, Misumi O:Algae sense exact temperatures: small heat shock proteins are expressed at the survival threshold temperature in Cyanidioschyzon merolae and Chlamydomonas reinhardtii. Genome Biology and Evolution, 6(10), 2731–2740, doi:10.1093/gbe/evu216, (2014)

4)※Kuroiwa T, Ohnuma M, Imoto Y, Kuroiwa H: Lipid Droplet Formation in Cells of the Filamentous Green Alga Klebsormidium nitens as Revealed by BODIOY– DiOC6 and BODIPY–Nile Red Double-staining Microscopy. Cytologia, 79(4), 501-507, DOI:10.1508/Cytologia.79.501, (2014)

5)※Aoyama H, Saitoh S, Kuroiwa T, Nakamura S: Comparative analysis of zygospore transcripts during early germination in Chlamydomonas reinhardtii. J. Plant Physiology, 171, 1685–1692, DOI:10.1016/j.jplph.2014.07.016, (2014)

6)※Kuroiwa T, Ohnuma M, Nozaki H, Imoto Y, Misumi O, Kuroiwa H: Cytological evidence of cell-nuclear genome size of a new ultrasmall unicellular freshwater green alga, Chlorophyte sp. Medakamo hakoo 311: I. Comparison with Cyanidioschyzon merolae and Ostreococcus tauri. Cytologia, 80, 143-150, DOI:10.1508/Cytologia.80.143, (2014)

7)※Aoyama H, Ono Y, Kuroiwa T, Nakamura S:Live imaging of mitochondrial morphology during vegetative cell cycle in Chlamydomonas reinhardtii. Cytologia, 80(3), Cover, 259-260, DOI:10.1508/Cytologia.80.259, (2015)

8) Ikuta T, Igawa K, Tame A, Kuroiwa T, Kuroiwa H, Aoki Y, Takaki Y, Nagai Y, Ozawa G, Yamamoto M, Deguchi R, Fujikura K, Maruyama T, Yoshida T: Surfing the vegetal pole in a small population: extracellular vertical transmission of an ‘intracellular’ a deep-sea clam symbiont. Royal society open science, 3, 160130, DOI: org/10.1098/rsos.160130, (2016)

9)※Kuroiwa T, Ohnuma M, Imoto Y, Misumi O, Nagata N, Miyakawa I, Fujishima M, Kuroiwa H:Cell-nuclear genome size of the ultrasmall unicellular freshwater green alga, Medakamo hakoo 311 as studied by DAPI staining after microwave oven treatments: II. Comparison with Cyanidioschyzon merolae, Saccharomyces cerevisiae (n, 2n) and Chlorella variabilis. Cytologia, 81, 69-76, DOI: 10.1508/cytologia.81.69, (2016)

10)※Yagisawa F, Kuroiwa H, Fujiwara T, Kuroiwa T:Intracellular structure of the unicellular red alga, Cyanidioschyzon merolae,in response to phosphate depletion and resupplementation. Cytologia, 81, 341-347, DOI: 10.1508/cytologia.81.341, (2016)

11)※Imoto Y, Abe Y, Okumoto K, Honsho M, Kuroiwa H,Kuroiwa T, Fujiki Y:Defining dynamin-based ring organizing center on the peroxisome-dividing machinery isolated from Cyanidioschyzon merolae. J. Cell Sci., 130, 853-867, doi:10.1242/jcs.199182 (2017)

12)※Fujiwara T, Ohnuma M, Kuroiwa T, Ohbayashi R, Hirooka S, Miyagishima S: Development of a double nuclear gene-targeting method by two-step transformation based on a newly established chloramphenicol-selection system in the red alga Cyanidioschyzon merolae. Frontiers in Plant Science, 8 Article, 343, 1-10, doi:10.3389/fpls.2017.00343. (2017)

13)※Kobayashi Y, Misumi O, Odahara M, Ishibashi K, Hirono M, Hidaka K, Endo M, Sugiyama H, Iwasaki H, Kuroiwa T, Shikanai T, Nishimura Y:Holliday junction resolvases mediate chloroplast nucleoid segregation. Science, 356(3668), 631-634, DOI: 10.1126/science.aan0038 (2017)

14)※Yoshida Y, Kuroiwa H, Shimada T, Yoshida M, Ohnuma M, Fujiwara T, Imoto Y, Yagisawa F, Nishida K, Hirooka S, Misumi O, Mogi Y, Akakabe Y, Matsushita K, Kuroiwa T: The glycosyltransferase MDR1 assembles a dividing ring for mitochondrial proliferation comprising polyglucan nanofilaments. Proc. Natl. Acad. Sci.USA, 114, 13284-13289, doi: 10.1073/pns.1715008114, (2017)

15)※黒岩常祥:シゾンとメダカモから探る真核生物の増殖の基本原理. Plant Morphology, 29, 63-71, (2017)

16) 黒岩常祥:自由な研究環境での独創的でオリジナリティのある基礎研究が「研究力」の基礎となる. 山田財団ニュース, 巻頭言, 1-3, (2018)

17)※Imoto Y, Abe Y, Honsho M, Okumoto K, Ohnuma M, Kuroiwa H, Kuroiwa T, Fujiki Y : Fueling GTP by DYNAMO1 drives constriction of mitochondrial and peroxisomal dividing ring. nature Comm., 9, 4634, doi: 10.1038/s41467-018-07009-z, (2018)

18)※Imoto Y, Abe Y, Okumoto K ,Ohnuma M, Kuroiwa H, Kuroiwa T, Fujiki Y: Dynamics of the nucleoside diphosphate kinase protein DYNAMO2 correlateds with the changes in the global GTP level during the cell cycle of Cyanidioscyzon merolae. Proc.Jap.Acad.Sci.Series B, 95,75-85, doi:10.2183/pjab.95.007, (2019)

豊岡公徳 (理化学研究所・上席研究員) 研究課題「高圧凍結技法を取り入れた広域EM画像撮影システムの開発とその応用」

1) 豊岡公徳,佐藤繭子,朽名夏麿,永田典子:高圧凍結技法を取り入れた広域透過電顕像自動取得システムの開発とその応用. Plant Morphology, 26, 3-8, (2014)

2) Toyooka K, Kang BH:Reconstructing plant cells in 3D by serial section electron tomography. Methods Mol., Biol., 1080, 159–170, (2014)

3)※Kobayashi K, Fuji S, Sato M, Toyooka K, Wada H:Specific role of phosphatidylglycerol and functional overlaps with other thylakoid lipids in Arabidopsis chloroplast biogenesis. Plant Cell Reports, 34, 631-42, (2014)

4)※Takahashi T, Sato M, Toyooka K, Matsuzaki R, Kawafune K, Kawamura M, Okuda K, Nozaki H:Five Cyanophora species delineated based on morphological and molecular data. J. Phycology, 50, 1058-1069, (2014)

5)※Yoshimoto K, Shibata M, Kondo M, Oikawa K, Sato M, Toyooka K, Shirasu K, Nishimura M, Ohsumi Y:Quality control of plant peroxisomes in organ specific manner via autophagy. J. Cell Sci., 127, 1161-1169, (2014)

6)※Xu B, Ohtani M, Yamaguchi M, Toyooka K, Wakazaki M, Sato M, Kubo M, Nakano Y, Sano R, Hiwatashi Y, Murata T, Kurata T, Yoneda A, Kato K, Hasebe M, Demura T:Contribution of NAC Transcription Factors to Plant Adaptation to Land. Science, 343, 1505-1508, (2014)

7)※Takahashi T, Sato M, Toyooka K, Nozaki H:Surface Ornamentation of Cyanophora paradoxa Cells as Revealed by Ultra-High Resolution Field Emission Scanning Electron Microscopy. Cytologia, 79, 1-5, (2014)

8)※Toyooka K, Sato M, Kutsuna N, Higaki T, Sawaki F, Wakazaki M, Goto Y, Hasezawa S, Nagata N, Matsuoka K:Wide-range high-resolution transmission electron microscopy reveals morphological and distributional changes of endomembrane compartments during log-to-stationary transition of growth phase in tobacco BY-2 cells. Plant Cell Physiol., 55, 1544-1555, (2014)

9) 豊岡公徳:高圧凍結技法を用いた細胞内小胞輸送経路の解明. 医生電顕技術誌, 28, 62-63,(2015)

10)※Toyosawa Y, Kawagoe Y, Matsushima R, Crofts N, Ogawa M, Fukuda M, Kumamaru T, Okazaki Y, Kusano M, Saito K,Toyooka K, Sato M, Ai Y, Jane JL, Nakamura Y, Fujita N:Deficiency of Starch Synthase IIIa and IVb Alters Starch Granule Morphology from Polyhedral to Spherical in Rice Endosperm. Plant Physiol., 170, 1255-1270, pii: pp.01232, (2015)

11)※Odahara M, Masuda Y, Sato M, Wakazaki M, Harada C, Toyooka K, Sekine Y:RECG Maintains Plastid and Mitochondrial Genome Stability by Suppressing Extensive Recombination between Short Dispersed Repeats. PLOS Genetics, 11, e1005080, (2015)

12)※Higaki T, Kutsuna N, Akita K, Sato M, Sawaki F, Kobayashi M, Nagata N, Toyooka K, Hasezawa S:Semi-automatic organelle detection on transmission electroln microscopic images. Scientific Reports, doi: 10.1038/srep07794, (2015)

13)※Onda Y, Hashimoto K, Yoshida T, Sakurai T, Sawada Y, Hirai YM, Toyooka K, Mochida K, Shinozaki K: Determination of growth stages and metabolic profiles in Brachypodium distachyon for comparison of developmental context with Triticeae crops. Proceedings of the Royal Society B, doi: 10.1098/rspb.2015.0964, (2015)

14)※Atarashi K, Tanoue T, Setoyama H, Ando M, Kamada N, Nagano Y, Narushima S, Suda W, Imaoka A,Setoyama H, Nagamori T, Ishikawa E, Shima T, Hara T, Kado S, Jinnohara T, Ohno H, Kondo T, Toyooka K, Watanabe E, Yokoyama SI, Tokoro S, Mori H, Noguchi Y, Morita H,Ivanoy II, Sugiyama T, Nuñez G, CampJG, Hattori M, Umesaki Y, Honda K:Th17 Cell induction by Adhesion of Microbes to Intestinal Epithelial Cells. Cell, 163, 367-380, (2015)

15)※Kobayashi K, Fuji S, Sato M, Toyooka K, Wada H: Specific role of phosphatidylglycerol and functional overlaps with other thylakoid lipids in Arabidopsis chloroplast biogenesis. Plant Cell Reports, 34(4), 631-642, 2015

16)※豊岡公徳 :光-電子相関顕微鏡法: 蛍光タンパク質標識した細胞小器官を走査電子顕微鏡で捉える.日本植物形態学会誌 Plant Morphology, 28, 15-21,(2016)

17)※Higuchi-Takeuchi M, Morisaki K, Toyooka K, Numata K:Synthesis of high-molecular-weight polyhydroxyalkanoates by marine photosynthetic purple bacteria. PLos ONE, doi: 10.1371/journal.pone.0160981, (2016)

18)※Tatsumi K, Yano M, Kaminade K, Sugiyama A, Sato M, Toyooka K, Aoyama T, Sato F, Yazaki K: Characterization of shikonin derivative secretion in Lithospermum eryrhirorizon hairy roots as a model of lipid-soluble metabolite secretion from plants. Front. Plant Sci., 7, 1066, (2016)

19)※Takahashi T, Nishida T, Tuji A, Saito C, Matsuzaki R, Sato M, Toyooka K, Yasuda H, Nozaki H:Delineation of six species of the primitive algal genus Glaucocystis based on in situ ultrastructural characteristics. Scientific Reports, 6, 29209, (2016)

20)※Nguyen C, Nakaminami K, Matsui A, Kobayashi S, Kurihara Y, Toyooka K, Tanaka M, Seki M: Oligouridylate Binding Protein 1b Plays an Integral Role in Plant Heat Stress Tolerance. Front. Plant Sci., 17. http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2016.00853., (2016)

21)※Kaneko K, Takamatsu T, Inomata T, Oikawa K, Itoh K, Hirose K, Amano M, Nishimura S, Toyooka K, Matsuoka K, PR J, Mitsui T:N-glycomic and microscopic subcellular localization analyses of NPP1, 2 and 6 strongly indicate that trans-Golgi compartments participate in the Golgi-to-plastid traffic of nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterases in rice. Plant Cell Physiol., doi: 10.1093/pcp/pcw089., (2016)

22)※Akita K, Kobayashi M, Sato M, Kutsuna N, Ueda T, Toyooka K, Nagata N, Hasezawa S, Higaki T: Cell wall accumulation of fluorescent proteins derived from a trans-Golgi cisternal membrane marker and paramural bodies in interdigitated Arabidopsis leaf epidermal cells. Protoplasma, 10.1007/2Fs00709-016-0955-1., (2016)

23)※Cui S, Wakatake T, Hashimoto K, Saucet SB, Toyooka K, Yoshida S, Shirasu K: Haustorial Hairs Are Specialized Root Hairs That Support Parasitism in the Facultative Parasitic Plant Phtheirospermum japonicum. Plant Physiol., 170, 1492-1503, doi: 10.1104/pp.15.01786, (2016)

24)※Toyooka K, Sato M, Wakazaki M, Matsuoka K: Morphological and quantitative changes in mitochondria, plastids, and peroxisomes during the log-to-stationary transition of the growth phase in cultured tobacco BY-2 cells. Plant Signaling & Behavior, 11, e1149669, doi: 10.1080/15592324.2016.1149669., (2016)

25)※Todaka D, Zhao Y, Yoshida T, Kudo M, Kidokoro S, Mizoi J, Kodaira KS, Takebayashi Y, Kojima M, Sakakibara H, Toyooka K, Sato M, Fernie AR, Shinozaki K, Yamaguchi-Shinozaki K:Temporal and spatial changes in gene expression, metabolite accumulation and phytohormone content in rice seedlings grown under drought stress conditions. Plant J., 2016 Dec 26. doi: 10.1111/tpj.13468. (2016)

26)※佐藤繭子,後藤友美,豊岡公徳:植物の免疫電子顕微鏡法. 顕微鏡, 52, 98-103, (2017)

27)※佐藤繭子,成川-篠崎苗子,豊岡公徳:植物と微生物の攻防を電子顕微鏡で捉えるには?. 植物科学の最前線(BSJ-Review), 8, 29, (2017)

28)※Nakabayashi R, Hashimoto K, Toyooka K, Saito K:Top-down metabolomic approaches for nitrogen-containing metabolites. Analytical Chemistry, 89(5), 2698-2703 ,2017

29)※Ito Y, Toyooka K, Fujimoto M, Ueda T, Uemura T, Nakano A:The trans-Golgi network and the Golgi stacks behave independently during regeneration after Brefeldin A treatment in tobacco BY-2 cells. Plant Cell Physiol., 58, 811-821, doi: 10.1093/pcp/pcx028., (2017)

30)※佐藤 繭子, 後藤 友美, 豊岡 公徳:植物の免疫電子顕微鏡法. 顕微鏡, 52, 98-103, (2017)

31)※佐藤 繭子,成川-篠崎 苗子,豊岡 公徳:植物と微生物の攻防を電子顕微鏡で捉えるには?. 植物科学の最前線, BSJ-Review, 8, 29, (2017)

32)※Sugiyama Y, Wakazaki M, Toyooka K, Fukuda H, Oda Y:A novel plasma membrane-anchored protein regulates xylem cell-wall deposition through microtubule-dependent lateral inhibition of Rho GTPase domains. Current Biology, 27, 2522-2528, (2017)

33)※Tanaka H, Sato M, Ogasawara Y, Hamashima N, Buchner O, Holzinger A, Toyooka K, Kodama Y:Chloroplast aggregation during the cold-positioning response in the liverwort Marchantia polymorpha L. J. Plant Research, doi: 10.1007/s10265-017-0958-9, (2017)

34)※Atarashi K, Suda W, Luo C, Kawaguchi T, Motoo I, Narushima S, Kiguchi Y, Yasuma K, Watanabe E, Tanoue T, Thaiss CA, Sato M, Toyooka K, Said HS, Yamagami H, Rice SA, Gevers D, Johnson RC, Segre JA, Chen K, Kolls JK, Elinav E, Morita H, Xavier RJ, Hattori M, Honda K:Ectopic colonization of oral bacteria in the intestine drives TH1 cell induction and inflammation. Science, 2017 Oct, 20,358(6361), 359-365, doi: 10.1126/science.aan4526, (2017)

35) Li W, Nguyen KH, Chu HD, Ha CV, Watanabe Y, Osakabe Y, Leyva-González MA, Sato M, Toyooka K, Voges L, Tanaka M, Mostofa MG, Seki M, Seo M, Yamaguchi S, Nelson DC, Tian C, Herrera-Estrella L, Tran LP: The karrikin receptor KAI2 promotes drought resistance in Arabidopsis thaliana. PLOS Genetics, 13 e1007076. 2017, doi: 10.1371/journal.pgen.1007076, (2017)

36)※Itouga M, Hayatsu M, Sato M, Tsuboi Y, Kato Y, Toyooka K, Suzuki S, Nakatsuka S, Kawakami S, Kikuchi J, Sakakibara H:Protonema of the moss Funaria hygrometrica can function as a lead (Pb) adsorbent. PLOS ONE, 12 e0189726. 2017, doi: 10.1371/journal.pone.0189726, (2018)

37)※Nakabayashi R, Hashimoto K, Toyooka K, Saito K:Top-down metabolomic approaches for nitrogen-containing metabolites. Analytical Chemistry. 89:2698-2703. doi: 10.1021/acs.analchem.6b04163(2018)

38)※Kitagawa M, Tomoi T, Fukushima T, Sakata Y, Sato M, Toyooka K, Fujita T, Sakakibara H:Abscisic Acid Acts as a Regulator of Molecular Trafficking through Plasmodesmata in the Moss Physcomitrella patens. Plant Cell Physiol, doi: 10.1093/pcp/pcy249, (2018)

39)※Cui Y, Cao W, He Y, Zhao Q, Wakazaki M, Zhuang X, Gao J, Zeng Y, Gao C, Ding Y, Wong H-Y, Wong W-S, Lam H-K, Wang P, Ueda T, Rojas-Pierce M, Toyooka K, Kang B-K, Jiang L:Whole cell electron tomography reveals the nature and biogenesis of vacuoles in Arabidopsis root cells. Nature Plants, doi: 10.1038/s41477-018-0328-1, (2018)

40)※Hamada T, Yako M, Minegishi M, Sato M, Kamei Y, Yanagawa Y, Toyooka K, Watanabe Y, Hara-Nishimura I:Stress granule formation is induced by a threshold temperature rather than a temperature difference in Arabidopsis. J Cell Sci, 131, doi: 10.1242/jcs.216051, (2018)

41)※Nakata,TM, Sato M, Wakazaki M, Sato N, Kojima K, Sekine A, Nakamura S, Shikanai T, Toyooka K, Tsukaya H, Horiguchi G:Plastid translation is essential for lateral root stem cell patterning in Arabidopsis thaliana. Biology Open, doi: 10.1242/bio.028175, (2018)

42)※佐藤繭子,若崎眞由美,後藤友美,豊岡公徳:高圧凍結法を用いた植物の電子顕微鏡解析. Plant Morphology, in press, (2019)

43) Toyooka K, Narakawa-Shinozaki N:Efficient fluorescence recovery using antifade reagents in correlative light and electron microscopy. Microscopy, (under review)

44)※Nakabayashi R, Hashimoto K, Toyooka K, Saito K:Keeping the shape of plant tissue for visualizing metabolite features in segmentation and correlation analysis of imaging mass spectrometry in Asparagus officinalis. Metabolomics, 15, 24, (2019)

45)※Sugiyama Y, Nagashima Y, Wakazaki M, Sato M, Toyooka K, Fukuda H, Oda Y:A Rho-actin signaling pathway shapes cell wall boundaries in Arabidopsis xylem vessels. Nature Communication, 10, 468, (2019)

46)※Ito-Inaba Y, Sato M, Sato MP, Kurayama Y, Yamamoto H, Ohata M, Ogura Y, Hayashi T, Toyooka K, Inaba T:AOX capacity of mitochondria in microsporophylls may function in cycad thermogenesis. Plant Physiol., in press


原口徳子 (情報通信研究機構・上席研究員) 研究課題「細胞内分子動態の超高分解能「その場」観察法開発」

1) 松田 厚志,平野 泰弘,原口徳子:超高分解蛍光顕微鏡法. 光アライアンス, 3月号, 31-35,(2014)

2)※Oana H, Nishikawa K, Matsuhara H, Yamamoto A, Yamamoto TG, Haraguchi T, Hiraoka Y, Washizu M: Non-destructive handling of individual chromatin fibers isolated from single cells in a microfluidic device utilizing an optically driven microtool. Lab Chip, 14(4), 696-704, doi: 10.1039/c3lc51111a, (2014)

3)※Asakawa H, Yang HJ, Yamamoto TG, Ohtsuki C, Chikashige Y, Sakata-Sogawa K, Tokunaga M, Iwamoto M, Hiraoka Y, Haraguchi T: Characterization of nuclear pore complex components in fission yeast Schizosaccharomyces pombe. Nucleus, 5(2), 149-162, doi:10.4161/nucl.28487, (2014)

4)※Nakano T, Kobayashi S, Suda T, Okaie Y, Hiraoka Y, Haraguchi T: Externally Controllable Molecular Communication Systems for Pattern Formation. ACM NANOCOM 2014 Proceedings, No.14, doi:10.1145/2619955.2619971, (2014)

5)※Nakano T, Kobayashi S, Suda T, Okaie Y, Hiraoka Y, Haraguchi T: Externally Controllable Molecular Communication. IEEE Journal of Selected Areas in Communications, 32(12), 2417-2431, (2014)

6)※Yamashita T, Liu D, Miki S, Yamamoto J, Haraguchi T, Kinjo M, Hiraoka Y, Wang Z, Hirotaka T: Fluorescence correlation spectroscopy with visible-wavelength superconducting nanowire single-photon detector. Opt. Express, 22(23), 28783–28789, (2014)

7)※Chikashige Y, Yamane M, Okamasa K, Mori C, Fukuta N, Matsuda A, Haraguchi T, Hiraoka Y: Chromosomes Rein Back the Spindle Pole Body during Horsetail Movement in Fission Yeast Meiosis. Cell Struct. Funct., 39, 93–100, doi: 10.1247/csf.14007, (2014)

8)※Kuramoto K, Sakai F, Yoshinori N, Nakamura TY, Wakabayashi S, Kojidani T, Haraguchi T, Hirose F, Osumi T: Deficiency of a lipid droplet protein, Perilipin 5, suppresses myocardial lipid accumulation, thereby preventing diabetes-induced heart malfunction. Mol. Cell Biol., 34(14), 2721-2731, doi: 10.1128/MCB.00133-14, (2014)

9)※Asakawa H, Hiraoka Y, Haraguchi T: A method of correlative light and electron microscopy for yeast cells. Micron, 61, 53-61, doi: 10.1016/j.micron.2014.02.007, (2014)

10)※Iwamoto M, Koujin T, Osakada H, Mori C, Kojidani T, Matsuda A, Asakawa H, Hiraoka Y, Haraguchi T: Biased assembly of the nuclear pore complex is required for somatic and germline nuclear differentiation in Tetrahymena. J. Cell Sci., 128 1812-1823, doi:10.1242/jcs.167353, (2015)

11)※Ruan K, Yamamoto TG, Asakawa H, Chikashige Y, Masukata H, Haraguchi T, Hiraoka Y: Meiotic nuclear movements in fission yeast are regulated by the transcription factor Mei4 downstream of a Cds1-dependent replication checkpoint pathway. Genes Cells, 20, 160-172, doi: 10.1111/gtc.12207, (2015)

12)※Haraguchi T, Osakada H, Koujin T: Live CLEM Imaging to Analyze Nuclear Structures at High Resolution. Methods Mol Biol., 1262:89-103. doi: 10.1007/978-1-4939-2253-6_6. In Nuclear Bodies and Noncoding RNAs, Methods and Protocols (Humana Press), (2015)

13)※Liu NA, Sun J, Kono K, Horikoshi Y, Ikura T, Tong X, Haraguchi T, Tashiro S: Regulation of homologous recombinational repair by lamin B1 in radiation-induced DNA damage. FASEB J., 29(6), 2514-2525, doi: 10.1096/fj.14-265546, (2015)

14)※Kobayashi S, Koujin T, Kojidani T, Osakada H, Mori C, Hiraoka Y, Haraguchi T: BAF is a cytosolic DNA sensor that leads to exogenous DNA avoiding autophagy. Proc Natl Acad Sci USA, 112(22), 7027-7032, doi: 10.1073/pnas.1501235112, (2015)

15)※Asakawa H, Mori C, Ohtsuki C, Iwamoto M, Hiraoka Y, Haraguchi T: Uncleavable Nup98-Nup96 is functional in fission yeast. FEBS Open Bio, 5, 508–514, doi: 10.1016/j.fob.2015.06.004, (2015)

16)※Matsuda A, Chikashige Y, Ding DQ, Ohtsuki C, Mori C, Asakawa H, Kimura H, Haraguchi T, Hiraoka Y: Highly condensed chromatins are formed adjacent to subtelomeric and decondensed silent chromatin in fission yeast. Nat. Commun., 6, 7753, doi: 10.1038/ncomms8753, (2015)

17)※Ruan K, Yamamoto T G, Asakawa H, Chikashige Y, Kimura H, Masukata H, Haraguchi T, Hiraoka Y: Histone H4 acetylation required for chromatin decompaction during DNA replication. Sci. Rep., 5, 12720, doi: 10.1038/srep12720, (2015)

18)※Iwamoto M, Hiraoka Y, Haraguchi T: The nuclear pore complex acts as a master switch for nuclear differentiation. Commun. Integr. Biol., 8, 4, e1056950, doi: 10.1080/19420889.2015.1056950, (2015)

19)※Kobayashi S, Haraguchi T: A novel pathway to detect and cope with exogenous dsDNA. Commun. Integr. Biol., 8(5), e1065361, doi:10.1080/19420889.2015.1065361, (2015)

20)※Tsuchiya M, Isogai S, Taniguchi H, Tochio H, Shirakawa M, Morohashi K, Hiraoka Y, Haraguchi T, Ogawa H: Selective autophagic receptor p62 regulates the abundance of transcriptional coregulator ARIP4 during nutrient starvation. Sci. Rep., 5, 14498, doi: 10.1038/srep14498, (2015)

21)※Chikashige Y, Arakawa S, Leibnitz K, Tsutsumi C, Mori C, Osakada H, Murata M, Haraguchi T, Hiraoka Y: Cellular economy in fission yeast cells continuously cultured with limited nitrogen resources. Sci. Rep., 5, 15617, doi: 10.1038/srep15617, (2015)

22)※Yang HJ, Asakawa H, Haraguchi T, Hiraoka Y:Nup132 modulates meiotic spindle attachment in fission yeast by regulating kinetochore assembly. J. Cell Biol., 211(2), 295-308, doi: 10.1083/jcb.201501035, (2015)

23)※Yamamoto J, Oura M, Yamashita T, Miki S, Jin T, Haraguchi T, Hiraoka Y, Terai H, Masataka K: Rotational diffusion measurements using polarization-dependent fluorescence correlation spectroscopy based on superconducting nanowire single-photon detector. Opt. Express, 23(25), 32633-32642, doi: 10.1364/OE.23.032633, (2015)

24)※Ohtsuki T, Miki S, Kobayashi S, Haraguchi T, Nakata E, Hirakawa K, Sumita K, Watanabe K, Okazaki S: The molecular mechanism of photochemical internalization of cell penetrating peptide-cargo-photosensitizer conjugates. Sci. Rep., 5, 18577, doi: 10.1038/srep18577, (2015)

25)※Ding DQ, Matsuda A, Okamasa K, Nagahama Y, Haraguchi T, Hiraoka Y: Meiotic cohesin-based chromosome structure is essential for homologous chromosome pairing in Schizosaccharomyces pombe. Chromosoma, 125 (2), 205-214, doi: 10.1007/s00412-015-0551-8, (2016)

26)※Yang HJ, Haraguchi T, Hiraoka Y: A nucleoporin that facilitates meiotic kinetochore reorganization. Cell Cycle, 15(3), 307-308, doi: 10.1080/15384101.2015.1125237, (2016)

27)※Asakawa H, Yang HJ, Hiraoka Y, Haraguchi T: Virtual nuclear envelope breakdown and its regulators in fission yeast meiosis. Front. Cell Dev. Biol., 4, 5, doi: 10.3389/fcell.2016.00005, (2016)

28)※Ding DQ, Haraguchi T, Hiraoka Y: A cohesion-based platform for homologous chromosome pairing in meiosis. Curr. Genet, 62(3), 499-502, doi: 10.1007/s00294-016-0570-x, (2016)

29)※Iwamoto M, Hiraoka Y, Haraguchi T: Uniquely designed nuclear structures of lower eukaryotes. Curr. Opin. Cell Biol., 40, 66-73, doi: 10.1016/j.ceb.2016.02.019, (2016)

30)※Matsumura S, Kojidani T, Kamioka Y, Uchida S, Haraguchi T, Kimura A, Toyoshima F: Interphase adhesion geometry is transmitted to an internal regulator for spindle orientation via caveolin-1. Nat. Commun., 7, 11858, doi: 10.1038/ncomms11858, (2016)

31)※Tsuchiya M, Ogawa H, Takako K, Kobayashi S, Mori C, Hiraoka Y, Haraguchi T: Depletion of autophagy receptor p62/SQSTM1 enhances the efficiency of gene delivery in mammalian cells. FEBS Lett., 590(16), 2671-80, doi: 10.1002/1873-3468, 12262, (2016) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27317902

32)※Tange Y, Chikashige Y, Takahata S, Kawakami K, Higashi M, Mori C, Kojidani T, Hirano Y, Asakawa H, Murakami Y, Haraguchi T, Hiraoka Y: Inner nuclear membrane protein Lem2 augments heterochromatin formation in response to nutritional conditions. Genes Cells, 21(8), 812-832, doi: 10.1111/gtc.12385, (2016) http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/gtc.12385/abstract

33)※Gómez-Saldivar G, Fernandez A, Hirano Y, Mauro M, Lai A, Ayuso C, Haraguchi T, Hiraoka Y, Piano F, Askjaer P: Identification of Conserved MEL-28/ELYS Domains with Essential Roles in Nuclear Assembly and Chromosome Segregation. PLoS Genet., 12(6), e1006131, doi: 10.1371/journal.pgen.1006131, (2016)http://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371%2Fjournal.pgen.1006131

34)※Kobayashi S, Iwamoto M, Haraguchi T: Live correlative light-electron microscopy to observe molecular dynamics in high resolution. Microscopy (Oxf), 65(4), 296-308, doi: 10.1093/jmicro/dfw024, (2016)

35)※Sato Y, Kujirai T, Arai R, Asakawa H, Ohtsuki C, Horikoshi N, Yamagata K, Ueda J, Nagase T, Haraguchi T, Hiraoka Y, Kimura A, Kurumizaka H, Kimura H: A Genetically Encoded Probe for Live-Cell Imaging of H4K20 Monomethylation. J. Mol. Biol., 428(20), 3885-3902, doi: 10.1016/j.jmb.2016.08.010, (2016)

36)※Asakawa H, Ding DQ, Haraguchi T, Hiraoka Y: Microscopic observation of living cells stained with fluorescent probes. In Fission Yeast: A Laboratory Manual, 230-235, (Cold Spring Harbor Laboratory Press), (2016)

37)※Matsuda A, Asakawa H, Haraguchi T, Hiraoka Y: Spatial organization of the Schizosaccharomyces pombe genome within the nucleus. Yeast, Oct 21. doi: 10.1002/yea.3217, (2016)

38)※Nakano T, Okaie Y, Kobayashi S, Koujin T, Chan CH, Hsu YH, Okaie Y, Obuchi T, Hara T, Hiraoka Y, Haraguchi T: Performance Evaluation of Leader-follower-based Mobile Molecular Communication Networks for Target Detection Applications. IEEE Transactions on Communications, Nov.11, (2016)

39)原口徳子,平岡泰: ライブクレム顕微鏡法. 生産と技術, 平成29年春号(第69巻2号), 59-64, (2017)

40)※Yang H-J, Osakada H, Kojidani T, Haraguchi T, Hiraoka Y: Lipid droplet dynamics during Schizosaccharomyces pombe sporulation and their role in spore survival. Biol. Open, 6, 217-222, doi:10.1242/bio.022384, (2017)

41)※Koyama M, Nagakura W, Tanaka H, Kujirai T, Chikashige Y, Haraguchi T, Hiraoka Y, Kurumizaka H: In vitro reconstitution and biochemical analyses of the Schizosaccharomyces pombe nucleosome. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2017 Jan 22, 482(4), 896-901, (2017)

42)※Chikashige Y, Yamane M, Okamasa K, Osakada H, Tsutsumi C, Nagahama Y, Fukuta N, Haraguchi T, Hiraoka Y: Fission yeast APC/C activators Slp1 and Fzr1 sequentially trigger two consecutive nuclear divisions during meiosis. FEBS Lett., 2017 Feb 28. doi: 10.1002/1873-3468.12612, (2017)

43)※Yang HJ, Iwamoto M, Hiraoka Y, Haraguchi T: Function of nuclear membrane proteins in shaping the nuclear envelope integrity during closed mitosis. J. Biochem., 161(6), 471-477, doi:10.1093/jb/mvx020, (2017)

44)※Kaur H, Sparvoli D, Osakada H, Iwamoto M, Haraguchi T, Turkewitz A.P: A late endosomal syntaxin and the AP-3 complex are required for formation and maturation of lysosome-related secretory organelles (mucocysts) in Tetrahymena thermophile. Mol. Biol. Cell, 28(11), 1551-1564, doi:10.1091/mbc.E17-01-0018, (2017)

45)※Iwamoto M, Osakada H, Mori C, Fukuda Y, Nagao K, Obuse C, Hiraoka Y, Haraguchi T: Compositionally distinct nuclear pore complexes of functionally distinct dimorphic nuclei in ciliate Tetrahymena. J. Cell Sci., 130(10), 1822-1834, doi: 10.1242/jcs.199398, (2017)

46) 岩本政明,原口徳子: 繊毛虫テトラヒメナの二種類の核を分ける核膜孔複合体の構造と動態. 藻類(Japanese Journal of Phycology), 65, 108-109, (2017)

47) Iwamoto M, Hiraoka Y, Haraguchi T:Newly found Tetrahymena nucleoporins, Nup214, Nup153 and Pom121/Pom82, differentiate nuclear pore complexes of functionally distinct nuclei. Commun. Integr. Biol., 03 Nov 2017, http://dx.doi.org/10.1080/19420889.2017.1384890, (2017)

48) 原口徳子: タイムラプスイメージング. 実験医学, 36(20), 3389-3390, (2018)

49) Hirano Y, Kinugasa Y, Asakawa H, Chikashige Y, Obuse C, HaraguchiT, Hiraoka Y:Lem2 is retained at the nuclear envelope through its interaction with Bqt4 in fission yeast. Genes to Cells, 23(3), 122-135, Epub 2018 Jan 2, doi:10.1111/gtc.12557, (2018)

50)Tsuchiya M, Ogawa H, Koujin T, Mori C, Osakada H, Kobayashi S, Hiraoka Y, Haraguchi T:p62/SQSTM1 promotes rapid ubiquitin conjugation to target proteins after endosome rupture during xenophagy. FEBS Open Bio, 8(3), 470-480, Epub 2018 Jan 23, doi:10.1002/2211-5463.12385, (2018)

51) Asakawa H, Hiraoka Y, HaraguchiT:Estimation of GFP-Nucleoporin Amount Based on Fluorescence Microscopy. Methods in Molecular Biology, 2018, 1721, 105-115, doi:10.1007/978-1-4939-7546-4_10, (2018)

52)Sparvoli D, Richardson E, Osakada H, Lan X, Iwamoto M, Bowman GR, Kontur C, Bourland WA, Lynn DH, Pritchard JK, Haraguchi T, Dacks JB, Turkewitz AP:Remodeling the Specificity of an Endosomal CORVET Tether Underlies Formation of Regulated Secretory Vesicles in the Ciliate Tetrahymena thermophila. Current Biology, 2018 Mar 5, 28(5), 697-710, e13. doi:10.1016/j.cub.2018.01.047, (2018)

53)Itoh G, Ikeda M, Iemura K, Amin MA, Kuriyama S, Tanaka M, Mizuno N, Osakada H, Haraguchi T, Tanaka K:Lateral attachment of kinetochores to microtubules is enriched in prometaphase rosette and facilitates chromosome alignment and bi-orientation establishment. Scientific Reports, 2018 Mar 1, 8(1), 3888, doi:10.1038/s41598-018-22164-5, (2018)

54) Matsuda A, Schermelleh L, Hirano Y, Haraguchi T, Hiraoka Y:Accurate and fiducial-marker-free correction for three-dimensional chromatic shift in biological fluorescence microscopy. Scientific Reports, 2018 May 15, 8(1), 7583, doi: 10.1038/s41598-018-25922-7, (2018)

55) Bao XX, Spanos C, Kojidani T, Lynch EM, Rappsilber J, Hiraoka Y,Haraguchi T, Sawin KE:Exportin Crm1 is repurposed as a docking protein to generate microtubule organizing centers at the nuclear pore. eLife, 2018;7:e33465 doi: 10.7554/eLife.33465, (2018)

56) Iwamoto M, Mori C, Osakada H, Koujin T, Hiraoka Y, Haraguchi T:Nuclear localization signal targeting to macronucleus and micronucleus in binucleated ciliate Tetrahymena thermophila. Genes to Cells, 08 June 2018;7:e33465 doi: 10.1111/gtc.12602, (2018)

57) Takao K, Takamiya K, Yamamoto T, Ding D-Q, HaraguchiT, Hiraoka Y, Nishimori H, Awazu A:Turning and twisting motion of chromosomes as an accelerating force to align homologous chromosomes during meiosis. Journal of the Physical Society of Japan, https://www.biorxiv.org/content/early/2018/12/12/459271, (2019)

58) Iwamoto M, Fukuda Y, Osakada H, Mori C, Hiraoka Y,Haraguchi T:Identification of the evolutionarily conserved nuclear envelope proteins Lem2 and MicLem2 in Tetrahymena thermophila. Gene: X, https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2590158319300038, (2019)

59)Kurokawa K, Osakada H, Kojidani T, Waga M, Suda Y, Asakawa H,Haraguchi T, Nakano A:Visualization of secretory cargo transport within the Golgi apparatus in living yeast cells. Journal of Cell Biology, in press (2019)

60)Bilir Ş, Kojidani T, Mori C, Kobayashi S, Koujin T, Hiraoka Y,HaraguchiT:Roles of Nup133, Nup153, and membrane fenestrations in assembly of the nuclear pore complex at the end of mitosis. Genes to Cells, in press (2019)

61) Asakawa H, Kojidani T, Yang HJ, Ohtsuki C, Osakada H, Matsuda A, Iwamoto M, Chikashige Y, Nagao K, Obuse C, Hiraoka Y, Haraguchi T: Asymmetrical localization of components of the Nup107-160 subcomplex within the nuclear pore complex in fission yeast. PLoS Genetics, in press (2019)

 

2.バイオイメージングで紐解く分子・細胞・個体の生命動作原理

分子チーム

菅野靖史 (理学部・教授) 研究課題「セルロース高生産酢酸菌におけるセルロース産生の仕組みとその機能の解明」

1)※Yoshida T, Sugano Y: A structural and functional perspective of DyP-type peroxidase family. Archives of Biochemistry and Biophysics, 574, 49-55, (2015)

2)※Yoshida T, Ogola HJ, Amano Y, Hisabori T, Ashida H, Sawa Y, Tsuge H, Sugano Y :Anabaena sp. DyP-type peroxidase is a tetramer consisting of two asymmetric dimers. Proteins, 84(1), 31-42, (2016)

3)※Sugawara K, Nishihashi Y, Narioka T, Yoshida T, Morita M, Sugano Y:Characterization of a novel DyP-type peroxidase from Streptomyces avermitilis. Journal of Bioscience and Biorngineering, 123, 425-430, (2017)


宮崎あかね (理学部・教授) 研究課題「環境中に存在する粒子物質と生体との相互作用の可視化」

1)※Saito E, Tanaka N, Miyazaki A, Tsuzaki M; Concentration and particle size distribution of polycyclic aromatic hydrocarbons formed by thermal cooking. Food Chemistry, 153, 285-291, (2014)

2)※吉田円香,宮崎あかね,緒方裕子:都市近郊の小規模森林樹冠に対する微量金属元素の沈着挙動. 大気環境学会誌, 49, 1, 53-58, (2014)

3)※Saito E, Tanaka N, Miyazaki A, Tsuzaki M:Concentration and particle size distribution of polycyclic aromatic hydrocarbons formed by thermal cooking. Food Chemistry, 153, 285-291, (2014)

4)※Papa F, Miyazaki A, Scurtu M, Ianculescu AC, Balint I: Morphology, chemical state of nanometric-sized Pt-Cu and Pt-Ag particles and their photocatalytic activity for mineralization of methanol. Journal of Nanoparticle Research, 16, 1-12, (2014)

5)※小島知子,宮崎あかね:アーバスキュラー菌根菌とミミズの共存が牧草の生育に及ぼす効果. 日本草地学会誌, 61(2), 83-92, (2015)

6)※Miyazaki A, Matsuda K, Papa F, Scurtu M, Negrila C, Dobrescu G, Balint I : Impact of particle size and metal-support interaction on denitration behavior of well-defined Pt-Cu nanoparticles. Catalysis Science & Technology, 5(1), 492-503, (2015)

7)※Yamashita MM, Ohashi H, Yoezu K, Miyazaki A, Okaue Y, Watanabe K, Ishida T, Tokunaga M, Yokoyama T: Sorption behavior of the Pt(II) complex anion on manganese dioxide (δ-MnO2): A model reaction to elucidate the mechanism by which Pt is concentrated into a marine ferromanganese crust. Mineralium Deposita, 51, 211-218, DOI 10.1007/s00126-015-0599-7, (2016)

8) 宮崎あかね,大河内博:森の生態系サービスについての研究.日本女子大学総合研究所紀要, 20, 106-116, (2017)

9)※Osaka N, Miyazaki A, Tanaka N:Emissions of volatile organic compounds from a swine shed, Asian Journal of Atmospheric Environment, 12, 17 (2018), 12(2), 178-191, (2017)

10)※State R, Scurtu M, Miyazaki A, Papa F, Atkinson I, Muteanu C,Balint I:Influence of metal-support interaction on nitrate hydrogenateon over Rh and Rh-Cu nanoparticles dispersed on Al2O3 and TiO2 supports. Arabian Journal of Chemistry, 10, 975-984, (2017)

11)※Sakai Y, Kawamoto D, Yokoyama T, Miyazaki A:Morphological development and coordinateon change in the course of Cd2+ hydrolysis. Bulletin of Chemical Society of Japan, 91, 1249-1251, (2018)


市川さおり (理学部・講師) 研究課題「ダニアレルゲンDer f 2による黄色ブドウ球菌由来脂溶性分子の引き抜き・運搬機序の解析」

1)※Suzuki M, Hara M, Ichikawa S, Kamijo S, Nakazawa T, Hatanaka H, Akiyama K, Ogawa H, Okumura K, Takai T: Presensitization to Ascaris antigens promotes induction of mite-specific IgE upon mite antigen inhalation in mice. Allergol Int., 65, 44-51, (2016)

2)※Kamijo S, Suzuki M, Hara M, Shimura S, Ochi H, Maruyama N, Matsuda A, Saito H, Nakae S, Suto H, Ichikawa S, Ikeda S, Ogawa H, Okumura K, Takai T: Subcutaneous allergic sensitization to protease allergen is dependent on mast cells but not IL-33: distinct mechanisms between subcutaneous and intranasal routes. J. Immunol., 196, 3559-3569, (2016)

 

細胞チーム

和賀祥(理学部・教授) 研究課題「細胞核内の複製因子の動態とDNA複製の解析」

1)※Budzowska M, Graham TGW, Sobeck A, Waga S, Walter, JC:Regulation of the Rev1-polζ complex during bypass of a DNA inter strand cross-link. EMBO J., 34, 1971-1985, (2015)

関本弘之(理学部・教授) 研究課題「ミカヅキモの有性生殖制御遺伝子群の分子的解析」

1)※Sato M, Sakayama H, Sato M, Ito M, Sekimoto H: Characterization of sexual reproductive processes in Chara braunii (Charales, Charophyceae). Phycol. Res., 62, 214-221, (2014)

2)※Tsuchikane Y, Nakai A, Sekimoto H:Detailed analysis on the parthenospore formation in Closterium moniliferum (Zygnematophyceae, Charophyta). Phycologia, 53(6), 571-578, (2014) http://dx.doi.org/10.2216/14-35R1.1

3)※Hirano N, Marukawa Y, Abe J, Hashiba S, Ichikawa M, Tanabe Y, Ito M, Nishii I, Tsuchikane Y, Sekimoto H:A receptor-like kinase, related with cell wall sensor of higher plants, is required for sexual reproduction in the unicellular charophycean alga, Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex. Plant Cell Physiol., 56, 1456-1462, (2015) –This paper was picked up in the Research Highlights section of this Issue.

4)※Delaux PM, Radhakrishnan GV, Jayaraman D, Cheema J, Malbreil M, Volkening JD, Sekimoto H, Nishiyama T, Melkonian M, Pokorny L, Rothfels CJ, Sederoff HW, Stevenson DW, Surek B, Zhang Y, Sussman MR, Dunand C, Morris RJ, Roux C, Wong GKS, Oldroyd GED, Ané JM: The algal ancestor of land plants was pre-adapted for symbiosis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 112, 13390-13395, (2015)

5)※Abe J, Hori S, Sato M, Sekimoto H:Concanavalin A disrupts the release of fibrous material necessary for zygote formation of a unicellular charophycean alga, Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex. Frontiers in Plant Science, 7, 1040, (2016)

6)※Abe J, Hirano N, Komiya A, Kanda N, Fujiwara A, Hori S, Tsuchikane Y, Sekimoto H:Preparation of knockdown transformants of unicellular charophycean alga, Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex. Bio-protocol, 6(10), e1813, (2016)

7)※Yamamoto K, Kawai-Toyooka H, Hamaji T, Tsuchikane Y, Mori T, Takahashi F, Sekimoto H, Ferris PJ, Nozaki H:Molecular evolutionary analysis of a gender-limited MID ortholog from the homothallic species Volvox africanus with male and monoecious spheroids. PLOS One, 12, e0180313, 10.1371/journal.pone.0180313. (2017)

8)※Sekimoto H:Sexual reproduction and sex determination in green algae. J. Plant Res., 130, 423-431, doi: 10.1007/s10265-017-0908-6. (2017)

9)※Kanda N, Ichikawa M, Ono A, Toyoda A, Fujiyama A, Abe J, Tsuchikane Y, Nishiyama T, Sekimoto H:CRISPR/Cas9-based knockouts reveal that CpRLP1 is a negative regulator of the sex pheromone PR-IP in the Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex. Sci. Rep., 7, 17873, 10.1038/s41598-017-18251-8. (2017)

10)※Tsuchikane Y, Kobayashi H, Kato M, Watanabe J, Wu J-T, Sekimoto H:Identification of a new mating group and reproductive isolation in the Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex., J. Plant Res., 131, 735-746, 10.1007/s10265-018-1043-8. (2018)

11)※Higo A, Kawashima T, Borg M, Zhao M, López-Vidriero I, Sakayama H, Montgomery SA, Sekimoto H, Hackenberg D, Shimamura M, Nishiyama T, Sakakibara K, Tomita Y, Togawa T, Kunimoto K, Osakabe A, Suzuki Y, Yamato KT, Ishizaki K, Nishihama R, Kohchi T, Franco-Zorrilla JM, Twell D, Berger F, Araki T:Transcription factor DUO1 generated by neo-functionalization is associated with evolution of sperm differentiation in plants. Nat. Commun., 9(1), DOI: 10.1038/s41467-018-07728-3. (2018)

12)※Tsuchikane Y, Sekimoto H:The genus Closterium, a new model organism to study sexual reproduction in streptophytes. New Phytol., 221, 99-104, 10.1111/nph.15334. (2019)

13)※Rahman H, Toda E, Kobayashi M, Kudo T, Koshimizu S, Takahara M, Iwami M, Watanabe Y, Sekimoto H, Yano K, Okamoto T:Expression of genes from paternal alleles in rice zygotes and involvement of OsASGR-BBML1 in initiation of zygotic development. Plant Cell Physiol. pcz030, https://doi.org/10.1093/pcp/pcz030. (2019)

永田三郎(理学部・教授) 研究課題「アフリカツメガエルIntelectinの局在性とその機能に関する研究」

1)※Nagata S :Identification and characterization of a novel intelectin in the digestive tract of Xenopus laevis. Dev. Comp. Immunol., 59, 229-239, (2016)

2)※Nagata S:Xenopus laevis macrophage-like cells produce XCL-1, an intelectin family serum lectin that recognizes bacteria. Immunol. Cell Biol., 96, 872-878, (2018)

 

個体チーム

今市涼子(理学部・客員研究員) 研究課題「分裂組織動態解析に基づく植物の形態進化の解明」

1) 今市涼子:シダ類配偶体の形態多様性と比較発生学 ー分裂組織動態に注目して. Plant Morphology, 26, 37-43, (2014)

2)※Fujinami R, Imaichi R:Developmental morphology of flattended shoots in Dalzellia ubonensis and Indodalzellia graciliswith implications for the evolution of diversified shoot morphologies in the subfamily Tristichoideae (Podostemaceae). Amer.J.Bot., 102, 848-859, (2015)

3)※Takahashi N, Kami C, Ota I, Morita N, Imaichi R:Developmental morphology of the typical cordate gametophyte of a homosporous leptosporangiate fern, Lygodium japonicum (Lygodiaceae), focusing on the initial cell behavior of two distinct meristems. Amer.J.Bot., 102, 197-207, (2015)

4)※Ogura TY, Hirayama Y, Sakoda A, Suzuki A, Ebihara A, Morita N, Imaichi R:Arbuscular mycorrizal colonization in filed-collected terrestrial gametophytes of pre-polypod leptosporangiate ferns (Osmundaceae, Gleicheniaceae, Plagiogyriaceae, Cyatheaceae). Mycorrhiza, DOI 10.1007/s00572-015-0648-1, 26, 87-97, (2016)

5)※Fujinami R, Yoshihama I,Imaichi R: Comparative morphology of chloroplasts in Podostemaceae subfamilyies Tristichoideae and Weddellijnoideae suggests evolution of chloroplast dimorphism. Acta Phytotax. Geobot., 67, 29-36, (2016)

6)※Katayama N, Kato M, Imaichi R: Habitat specificity enhances genetic differentiation in two species of aquatic Podostemaceae in Japan. Amer. J. Bot., 103, 317–324, (2016)

7)※Fujinami R, Yamada T, Nakajima A, Takagi S, Idogawa A, Kawakami E, Tsutsumi M, Imaichi R: Root apical meristem diversity in extant lycophytes and implications for root origins. New Phytologist, 215,1210-1220, (2017)

8)※Imaichi R, Moritoki N, Solvang HK: Evolution of root apical meristem structures in vascular plants: plasmmodesmatal networks. Amer. J. Bot., 105, 1-16, (2018)


宮本武典(理学部・教授) 研究課題「味蕾の再構成の試みおよび味覚情報伝達系のロバストネスの解析」

1)※Suzuki E, Eda-Fujiwara H, Saito R, Satoh R, Miyamoto T: Enhancement of conditioned taste aversion after long-term intracranial injection of oxytocin in mice. Chemical Senses, 39, 110, (2014)

2)※Asahina Y, Eda-Fujiwara H, Satoh R, Yasoshima Y, Miyamoto T: Neural pathway contributing to control of sucrose preference by body weigh. Journal of Physiological Science, 65, S271, (2015)

3)※鈴木惠雅,宮本武典: マウス味覚嫌悪学習後の消去記憶形成に伴う関連脳部位でのシナプスの可塑性. 比較生理生化学, 32, 76-77, (2015)

4)※Munetomo A, Ishii H, Miyamoto T, Sakuma Y, Kondo Y: Puerperal and parental experience alter rat preference for pup odors via change in the oxytocin system. J. Reprod. Dev., 62, 17-27, (2015)

5)※Eda-Fujiwara H, Satoh R, Hata Y, Yamasaki M, Watanabe A, Zandbergen MA, Okamoto Y, Miyamoto T, Bolhuis JJ: Sex differences in behavioural and neural responsiveness to mate callsin a parrot. Sci Report, 6,18481, (2015)

6)※Yasoshima Y, Yoshizawa, H, Shimura T, Miyamoto T: The basolateral nucleus of the amygdala mediates caloric sugar preference over a non-caloric sweetener in mice. Neurosci., 291, 203-215, (2015)

7)※Katsumata E, Mitsuhashi Y, Nishiyama M, Tomooka Y, Miyamoto T: An analysis of transduction mechanism of sourand salty tastes in clonal cell lines derived from murine taste buds. Chemical Senses, 41, e227, (2016)

8)※Suzuki E, Nakazato Y, Nakano H, Sako T, Miyamoto T: The central processing of salt taste quality induced by neutralizing a basic amino acid, arginine and its enhancement with inosine monophosphate. Chemical Senses, 41, e270 (2016)

9)※Kawauchi Y, Hayashi R, Nakazato Y, Nakano H, Sako T, Miyamoto T: Analysis of brain mechanism contributing to change of taste preference in human induced by umami enhancer, IMP. Journal of Physiological Science, 67, S127, (2017)

10)※Ayukawa S, Suzuki E, Hyodo M, Munetomo A, Eda-Fujiwara H, Watanabe A, Saito R, Satoh R, Tsuneoka T, Miyamoto T: The effect of testosterone on synaptic plasticity in brain areas related toextinction memory retention after conditioned taste aversion in mice. Journal of Physiological Science, 67, S129, (2017)

11)※Ayukawa S, Yoshida A, Watanabe A, Eda-Fujiwara H, Saito R, Satoh R, Tsuneoka T, Miyamoto T:Synapticplasticity induced by androgen in the brain area related to extinction memoryacquisition after conditioned taste aversion in mice. Journal of Physiological Sciences, 68, S161, (2018)

12)※Yoshida A, Ayukawa S, Watanabe A, Eda-Fujiwara H, Satoh R, Miyamoto T:Age-dependent difference of neophobia and conditioned taste aversion in mice. Chemical Senses, 43, (in press), (2018)

13)※吉田彩乃,鮎川紫苑,渡辺愛子,藤原宏子,佐藤亮平,宮本武典:マウスの新奇恐怖および味覚嫌悪記憶の週齢差. 日本味と匂学会誌, 第52回大会Proceeding集, S69-S72, (2018)

深町昌司(理学部・准教授) 研究課題「配偶選択や個体識別に影響する視覚刺激の定量的解析」

1) 深町昌司: 色覚と性的嗜好の研究モデルとしてのメダカ. 化学とマイクロ・ナノシステム, 13, 2-9, (2014)

2) 林牧子,深町昌司: 裸鰓目ウミウシ幼生の飼育の試み. うみうし通信, 84, 4-5, (2014)

3)※Utagawa U, Higashi S, Kamei Y, Fukamachi S: Characterization of assortative mating in medaka: Mate discrimination cues and factors that bias sexual preference. Horm Behav, 84, 9-17, (2016)

4)※Komine R, Nishimaki T, Kimura T, Oota H, Naruse K, Homma N, Fukamachi S: Transgenic medaka that overexpress growth hormone have a skin color that does not indicate the activation or inhibition of somatolactin-α signal. Gene, 584, 38-46, (2016)

5)※Homma N, Harada Y, Uchikawa T, Kamei Y, Fukamachi S: Protanopia (red color-blindness) in medaka: a simple system for producing color-blind fish and testing their spectral sensitivity. BMC Genet, 18, 10, (2017)

6)※Ikawa M, Ohya E, Shimada H, Kamijo M, Fukamachi S: Establishment and maintenance of sexual preferences that cause a reproductive isolation between medaka strains in close association. Biol Open, 6, 244-251, (2017)

7)※Shimmura T, Nakayama T, Shinomiya A, Fukamachi S, Yasugi M, Watanabe E, Shimo T, Senga T, Nishimura T, Tanaka M, Kamei Y, Naruse K, & Yoshimura T: Dynamic plasticity in phototransduction regulates seasonal changes in color perception. Nat Commun, 8, 412, (2017)

8)※Kamijo M, Kawamura M, Fukamachi S: Loss of red opsin genes relaxes sexual isolation between skin-colour variants of medaka. Behav Processes, 150, 25-28, (2018)

9)※Matsuo M, Ando Y, Kamei Y, Fukamachi S: A semi-automatic and quantitative method to evaluate behavioral photosensitivity in animals based on the optomotor response (OMR). Biol Open, 7, bio033175, (2018)

10)深町昌司: 体色・色覚と配偶者選択 -色違いメダカ間で起こる配偶前生殖隔離のメカニズム-. 生物の科学 遺伝 72, 611-616, (2018)

11)竹内秀明,深町昌司,亀井保博,成瀬清: メダカの行動学研究の最先端 -メダカはなぜ豊かな色彩を持つのか?-. 生物の科学 遺伝 72, 608-610, (2018)

12)※Harada Y, Matsuo M, Kamei Y, Goto M, Fukamachi S: Evolutionary history of the medaka long-wavelength sensitive genes and effects of artificial regression by gene loss on behavioural photosensitivity. Sci Rep, (in press)


 

図書

1.光顕と電顕をつなぐ新しいバイオイメージング技術開発

永田典子

1) Nagata N: The selective increase or decrease of organelle DNAs in young generative cells controls cytoplasmic inheritance in higher plants. “Atlas of Plant Cell Structure” Springer, 170-171, (2014)

2) Shirasawa K, Ban T, Nagata N, Murakana T:Impact of Genomics on Capsicum breeding. The Capsicum Genome (Ramchiary N. and Kole C. eds) Springer, 209-219, (2019)

小川賀代

1) 森本康彦,永田智子,小川賀代,山川修(編著):教育分野におけるeポートフォリオ,ミネルヴァ書房, 80-120,(2017)

鈴木智子

1) Suzuki T, Maeda A, Hirose M, Ichinose Y, Shiraishi T, Toyoda K: Ultrastructural and cytological studies on Mycosphaerella pinodes infection of the model legume Medicago truncatula. Frontiers in Plant Science. In Frontiers in Plant Science e-book: Advances in Ascochyta Reserch, (Rubiales D, Fondevilla S, Chen W, Davidson J, eds), Frontiers Media SA, Switzerland. 171-191, doi 10.3389/978-2-88945-634-5 (2018)

黒岩常祥

1) Kuroiwa H, Kuroiwa T:Zygote cell and sperm cell at the early em bryogenesis in a higher plant, Pelargonium zonale Ait. In Atlas in Plant Cell Structure (Eds. Noguchi, T., et al.), Springer, 182,(2014)

2) Kuroiwa H, Kuroiwa T:Egg cells with giant mitochondria in a higher plant, Pelargonium zonale Ait. In Atlas in Plant Cell Structure (Eds. Noguchi, T., et al.), Springer, 180,(2014)

3) Kuroiwa H, Kuroiwa T:Production of oil bodies in response to nitrogen starvation in Chlamydomonas reinhardtii. In Atlas in Plant Cell Structure (Eds. Noguchi, T., et al.), Springer, 108,(2014)

4) Kuroiwa H, Kuroiwa T:Chloroplast division machinery in Pelargonium zonale as revealed by immunofluorescence and electron microscopy. In Atlas in Plant Cell Structure (Eds. Noguchi, T., et al.), Springer, 66, 2014.

5) Yoshida Y, Kuroiwa T:Chloroplasts divide by contraction of a bundle of polyglucan nanofilament. In Atlas in Plant Cell Structure (Eds. Noguchi, T., et al.), Springer, 48, (2014)

6) Kuroiwa H, Kuroiwa T:Lipid body production in response to nitrogen starvation in Chlamydomonas reinhardtii. In Atlas in Plant Cell Structure, Springer,(2014)

7) Kuroiwa T, Kuroiwa H:Mechanisms of division and inheritance of mitochondria and chloroplasts as revealed by help of superior researchers. In Atlas in Plant Cell Structure, Springer,(2014)

8) 黒岩常祥:細胞,原始から未来への鍵「人間と文化」, 三愛新書, (2014)

9) Misumi O, Kuroiwa T, Hirooka S:Application of the tolerance to extreme environment to landa plants, In Cyanidioschyzon merolae: A New Model Eukaryote for Cell and Organelle Biology, (Eds. Kuroiwa T, et al.), Springer, (2018).

10) Kuroiwa T, Miyagishima S, Matsunaga S: Preface, In Cyanidioschyzon merolae: A New Model Eukaryote for Cell and Organelle Biology (Eds. Kuroiwa T, et al.), Springer, (2018).

11) Kuroiwa T, Miyagishima S, Matsunaga S, Sato N, Nozaki H, Tanaka K, Misumi O: Editors, In Cyanidioschyzon merolae: A New Model Eukaryote for Cell and Organelle Biology, Springer, (2018).

原口徳子

1) Haraguchi T, Osakada H, Koujin T: Live CLEM Imaging to Analyze Nuclear Structures at High Resolution. Methods in Molecular Biology, In Nuclear Bodies and Noncoding RNAs, Methods Mol. Biol. (Nakagawa S, Hirose T, eds), Humana Press, 1262, 89-103, doi: 10.1007/978-1-4939-2253-6_6, (2015)

2) 原口徳子(共著): 観察法. 蛍光イメージング「発光の事典」, 588-594, (木下修一他編), 朝倉書店, (2015)

3) 原口徳子(共著): FRET「新・生細胞蛍光イメージング」, (原口徳子他編), 共立出版, 299-302, (2015)

4) 原口徳子: 生細胞タイムラプス「新・生細胞蛍光イメージング」, (原口徳子他編), 共立出版, 277-285, (2015)

5) 木村宏,金城政孝,原口徳子,平岡泰: 蛍光色素・蛍光タンパク質「新・生細胞蛍光イメージング」, 共立出版, 101-113, (原口徳子他編), (2015)

6) 原口徳子: 生細胞試料の準備「新・生細胞蛍光イメージング」, (原口徳子他編), 共立出版, 96-100, (2015)

7) 原口徳子(共著): スペクトルイメージング「新・生細胞蛍光イメージング」, (原口徳子他編), 共立出版, 43-48, (2015)

8) 原口徳子(共著): マルチカラータイムラプス蛍光顕微鏡「新・生細胞蛍光イメージング」,(原口徳子他編), 共立出版, 34-42, (2015)

9) 原口徳子,木村宏,平岡泰(編著): 新・生細胞蛍光イメージング, 共立出版, 全352ページ, (2015)

10) Asakawa H, Ding DQ, Haraguchi T, Hiraoka Y: Microscopic Observation of Living Cells Stained with Fluorescent Probes. In Fission Yeast: A Laboratory Manual, (Hagan I, Carr A, Grallert A, Nurse P, eds), Cold Spring Harbor Laboratory Press, 230-235, (2016)

 

2.バイオイメージングで紐解く分子・細胞・個体の生命動作原理

宮崎あかね

1)  Balint I, Miyazaki A : Platinum nanoparticles: synthesis and catalytic properties. in Dekker Encyclopedia of Nanoscience and Nanotechnology (3rd Edition) Edited by Sergey Edward Lyshevski, Marcel Dekker, New York, 3673-3682, (2014)

関本弘之

1) Sekimoto H(共著):Sexual Reproduction in Animals and Plants. (Sawada H et al. eds), Springer, 345-357, (2014)

2) Sekimoto H(共著): Reproductive Biology of Plants. (Ramawat KG ed), CRC press, 29-56, (2014)

3) 関本弘之(共著):動植物の受精学.(澤田均 編著),化学同人,60-75, (2014)

永田三郎

1) 永田三郎:レクチン−糖鎖を認識して自己と非自己を識別する.(日本動物学会編),丸善出版,506-507,(2018)

深町昌司

1) 深町昌司(共著):魚類における色素形成の遺伝的背景とその意義. 伊藤祥輔・柴原茂樹・錦織千佳子監修 色素細胞第2版 ー基礎から臨床へー, 慶應義塾大学出版会, 160-171, (2015)

2) 深町昌司(共著):動物学の百科事典. 日本動物学会編, 丸善,186-187, (2018)

今市涼子

1) Imaichi R(共著): Atlas of Plant Cell Structure. Noguchi T et al., eds.Springer, (2014)

2) 今市涼子(共著):植物学の百科事典. 日本植物学会編, 丸善,(2016)

活動報告(2009年~2018年)

シンポジウム

日本植物学会第73回(山形)認定NPO法人綜合画像研究支援共催シンポジウム

2009年9月18日(金)開催

日本植物学会第73回(山形)認定NPO法人綜合画像研究支援共催シンポジウム
「 ❝形を見る❞ 技術は植物科学の発展にどのように寄与してきたか?」(BIC後援)

オーガナイザー:大隅正子(IIRS、日本女子大・BIC)
        峰雪芳宣(兵庫県立大・生命科学)
座長:峰雪芳宣、寺島一郎

形態観察と生態学             寺島一郎(東京大)
顕微鏡切片作製技術と陸上植物の比較形態学 今市涼子(日女大)
顕微鏡技術と藻類の形態形成        本村泰三(北海道大)
ディジタル画像処理技術と細胞の分裂    峰雪芳宣(兵庫県立大)
電子顕微鏡技術とオルガネラの分裂     宮城島進也(理研)
総合討論


日本女子大学バイオイメージングセンター 第1回公開シンポジウム

2009年10月3日(土)開催

日本女子大学バイオイメージングセンター 第1回公開シンポジウム
「生命現象をイメージングする」(BIC主催、IIRS後援)

 DNA複製開始の分子ダイナミクス 和賀祥
 ミカヅキモの有性生殖をイメージングする 関本弘之
 イメージングで紐解く知られざる花粉の秘密 永田典子
 味蕾の再構成の試みとバイオイメージング 宮本武典
 シダ植物前葉体の「かたち」と菌共生 今市涼子
 金属ナノ粒子のイメージング 宮崎あかね
 アレルゲンはなぜアレルゲンになるのか 市川さおり

サイエンスカフェ

 

日本女子大学バイオイメージングセンター 第2回公開シンポジウム

2010年9月23日(木)開催

日本女子大学バイオイメージングセンター 第2回公開シンポジウム
「不思議を『観る』」(BIC主催、IIRS後援) 

 激流を生き抜くために形を変えた不思議な植物      藤波理恵子
 ミカヅキモの生殖を観る~初めて観察された自殖の瞬間~ 土金勇樹
 光るミカヅキモを作る                 阿部淳
 言葉を覚えるオウム:脳を観て記憶の謎をさぐる     藤原宏子
 アレルギーのミステリー~アレルゲン蛋白質の形と働き~ 市川さおり

サイエンスカフェ

 

日本女子大学バイオイメージングセンター 第3回公開シンポジウム

2011年10月15日(土)開催

日本女子大学バイオイメージングセンター 第3回公開シンポジウム
「形の不思議」(BIC主催、IIRS後援)
 
 金属ナノ粒子の形とはたらき            宮崎あかね 
 花粉の美しい模様はどのようにして作られるのか   永田典子 
 熱帯の貧栄養地帯を生きる植物の多様な形と生活   今市涼子
 緑藻ボルボックスの反転-球体の表裏逆転の仕組み- 西井一郎(奈女大)
 細胞膜に魅せられる秩序構造形成          諸根信弘(京大)

懇親会

 

第2回先端味覚研究セミナー

2012年8月24日(金)・25日(土)開催

第2回先端味覚研究セミナー(二宮裕三教授 IFF Award受賞記念)
(第2回先端味覚研究セミナー組織委員会主催、BIC共催)

第1部
 大阪大学大学院人間科学研究科  乾賢
 京都大学大学院農学研究科   松村成暢
 石川県立大学生物資源環境学部 海老原充
 東京大学農学生命科学研究科  石丸善朗
 東京大学農学生命科学研究科  岡田普治
 電気通信大学情報理工学部   中村厚志
第2部 IFF Award受賞記念講演
 九州大学大学院歯学研究院   二ノ宮裕三
第3部
 九州大学大学院歯学研究院   吉田竜介
 農研機構食品総合研究所    日下部裕子
 九州大学大学院歯学研究院   上瀧奨史
 九州大学大学院歯学研究院   重村憲徳

 

日本女子大学バイオイメージングセンター 第4回公開シンポジウム

2012年10月27日(土)開催

日本女子大学バイオイメージングセンター 第4回公開シンポジウム
「新しい顕微鏡技術が見せる精巧な生き物の世界」(BIC主催、IIRS後援)

組織深部のライブイメージングと光細胞操作で花の内部を探る 
             名古屋大学大学院理学研究科 東山哲也、栗原大輔
二光子冷機顕微鏡がとらえる脳内神経回路の動的変化
                  東京大学大学院医学系研究科 岡部繁男
ライブセルイメージングによる細胞動態解析
                     東京理科大学理工学部 松永幸大
走査電子顕微鏡による細胞や組織のステレオイメージング
                新潟大学大学院医歯学総合研究科 牛木辰男 
性機能調節-エネルギー制御-
ストレス応答に関わる相互神経制御システムに関する形態科学的解析
                 日本医科大学大学院医学研究科 小澤一史
電子顕微鏡における広域画像取得法の開発と網羅的オルガネラ解析
                      日本女子大学理学部 永田典子

 

日本女子大学バイオイメージングセンター 第5回公開シンポジウム

2013年10月5日(土)開催

日本女子大学バイオイメージングセンター 第5回公開シンポジウム
「生命の不思議に挑む」(BIC主催、IIRS後援)

シダ類の微小な体、前葉体と菌類の共生              今市涼子
味の受容と識別機構の謎を解く鍵                 宮本武典
葉緑体の形成機構解明をめざした透過電子顕微鏡によるオミクス解析 永田典子
ダニアレルゲンの構造と機能:アレルギー疾患における意義     市川さおり
ヒメミカヅキモの有性生殖機構 -生理学的・分子生物学的解析-    関本弘之
オークよ、あなたの好物はいったい何なのか?
           ~ヒトのDNA複製開始点の解明を目指して~ 和賀祥

 

日本女子大学バイオイメージングセンター シンポジウム2014 

2014年12月6日(土)開催

日本女子大学バイオイメージングセンター シンポジウム2014
「分子・細胞・個体の生命動作原理を解き明かすために」

バイオイメージングセンターの過去・現在・未来 センター代表   永田典子
マイクロ血管実験室の構築           開発チーム    佐藤香枝
セルロース生合成メカニズムに迫る       分子チーム    菅野靖史
生体防御と動物レクチン            細胞チーム    永田三郎
メダカの配偶者選び              個体チーム    深町昌司
閉会の辞                   理学研究科委員長 宮本武典

 

日本女子大学バイオイメージングセンター シンポジウム2015 

2015年12月5日(土)開催

日本女子大学バイオイメージングセンター シンポジウム2015
「バイオイメージングで解き明かす生命動作原理〜光学顕微鏡と電子顕微鏡の橋渡し」

 

日本女子大学バイオイメージングセンター シンポジウム2016 

2016年10月22日(土)開催

日本女子大学バイオイメージングセンター シンポジウム2016
「バイオ周辺領域とイメージングとの関わり」

 

日本女子大学バイオイメージングセンター シンポジウム2017 

2017年12月16日(土)開催

日本女子大学バイオイメージングセンター シンポジウム2017
「見るを極める技術・光で操作する技術〜光学顕微鏡の今〜」

 

日本女子大学バイオイメージングセンター シンポジウム2018

2018年12月15日(土)開催

日本女子大学バイオイメージングセンター シンポジウム2018
「バイオロジーとケミストリーの交差点にて」

 

ワークショップ

日本顕微鏡学会第65回学術講演会(仙台) 綜合画像研究支援(IIRS)冠ワークショップ

2009年5月28日(木)開催

日本顕微鏡学会第65回学術講演会(仙台) 綜合画像研究支援(IIRS)冠ワークショップ
(日本女子大学オープン・リサーチ・センター協賛)

「微細形態科学研究装置共同利用ネットワークの発足にあたり」
1.微細形態科学研究装置共同利用ネットワークの仕組み
   綜合画像研究支援(IIRS)理事                山科正平
2.基幹施設の紹介
   松本歯科大学 総合歯科医学研究所教授            小澤英浩
   岩手医科大学 共同研究部門 バイオイメージングセンター教授 遠山稿二郎
   埼玉医科大学中央研究施設形態学部門教授           穐田真澄
   東京慈恵医科大学分子細胞生物学研究部教授          馬目佳信
   日本女子大学電子顕微鏡施設                 佐藤眞美子
3.総合討論

 

第6回可視化技術ワークショップ

2009年11月14日(土)開催

第6回可視化技術ワークショップ「肝臓の星細胞のイメージング」
(IIRS主催、BIC共催、社団法人日本顕微鏡学会後援)
星細胞の史的背景と古典的イメージング
  東京医科歯科大学名誉教授              和氣健二郎
肝星細胞と線維化病態
  東海大学医学部肝線維化研究ユニット教授       稲垣豊
肝星細胞から発見されたヘモグロビン様蛋白質の構造と機能
  大阪市立大学大学院医学研究科肝胆膵病態内科学教授  河田則文

 

日本顕微鏡学会第66回学術講演会(名古屋) IIRS冠ワークショップ

2010年5月24日(月)開催

日本顕微鏡学会第66回学術講演会(名古屋)
IIRS冠ワークショップ(BIC後援)
「医学・生物学における電子顕微鏡学の貢献」
IIRSについて
  綜合画像研究支援(IIRS)理事長   大隅正子
CUMNETについて
  綜合画像研究支援(IIRS)理事    山科正平
骨の微細形態科学‐方法論の展開と応用‐
  松本医科大学           小澤英浩

第7回可視化技術ワークショップ

2010年11月6日(土)開催

第7回可視化技術ワークショップ「急速に進化する3Dイメージングと3D構築法」
(IIRS主催、BIC共催、社団法人日本顕微鏡学会後援)
実態顕微鏡・光学顕微鏡の3Dビデオイメージング
  (株)メタコーポレーションジャパン       高岡英二
連続エポン切片を用いた胚や組織の3Dイメージング
  埼玉医科大学医学部解剖学           駒崎伸二
トモグラフィー法を用いた植物細胞・組織の3D解析
  兵庫県立大学大学院生命理学研究科       峰雪芳宣
走査電子顕微鏡の3Dイメージング
  新潟大学大学院歯学総合研究科顕微解剖学    牛木辰男
各種3D表示方式と液晶モニターの現在
  (株)ナナオ 映像商品開発部          伊藤 広

 

日本顕微鏡学会第67回学術講演会(福岡) IIRS冠ワークショップ

2011年5月17日(火)開催

日本顕微鏡学会第67回学術講演会(福岡)
IIRS冠ワークショップ(BIC後援)
「3Dデバイスの現状と将来」
       東京農工大学大学院工学研究院 高木康博

 

第8回可視化技術ワークショップ

2011年6月18日(土)開催

第8回可視化技術ワークショップ「3Dイメージング技法と3D構築法が切り開く新しい世界」
(IIRS主催、BIC共催、社団法人日本顕微鏡学会後援)
3D構築とボリュームレンダリングの基礎
   (株)メタコーポレーションジャパン      高沖英二
レーザー顕微鏡と多光子顕微鏡の3D構築
   岩手医科大学医学部解剖学          人見次郎
電子線トモグラフィの原理と単粒子・結晶解析への応用 
   (独)産業技術総合研究所           光岡 薫
フリーズレプリカのステレオイメージング
   名古屋大学エコトピア科学研究所       臼倉治郎
3D走査顕微鏡とマニピュレーション
   静岡大学工学部               岩田太

 

植物電子顕微鏡若手ワークショップ2012

2013年1月15日(火)・16日(水)開催

植物電子顕微鏡若手ワークショップ2012
(理化学研究所植物科学研究センター、BIC共催)
1月15日(火)
講演1)村田隆(基生研)
  「蛍光顕微鏡でできること、電子顕微鏡でできること」
講演2)林八寿子(新潟大)
  「植物細胞における脂質代謝に関わるオルガネラの機能形態学的解析」
ショートプレゼンテーション
ポスター発表
講演3)唐原一郎
  「加圧凍結法を用いたタマネギ子葉表皮細胞の分裂準備帯における膜系の解析」
講演4)朴 杓允(神戸大)
  「電顕アーティファクト」

1月16日(水)
ポスター討論
技術相談会&施設見学

 

植物電子顕微鏡若手ワークショップ2013

2013年11月22日(金)開催

植物電子顕微鏡若手ワークショップ2013
(理化学研究所 環境資源科学研究センター、BIC共催)

 

植物電子顕微鏡若手ワークショップ2014

2014年12月5日(金)開催

植物電子顕微鏡若手ワークショップ2014
 (第5回植物電子顕微鏡若手ワークショップ)
(理化学研究所 環境自然科学研究センター、BIC共催)

SEM解析とプロテオーム解析によるプラントオパール研究の新展開           尾崎紀昭(秋田県立大)
植物の元素イメージング:蛍光インディケーターを用いたナトリウムイオンイメージング 小笠原望実(名古屋大)
鉄酸化細菌がつくるユニークな酸化鉄の微細構造                   鈴木智子(岡山大)
FE-SEMを用いた光-電子相関顕微鏡法の開発                      豊岡公徳(理研CSRS)
SBC-SEMとライブセルイメージングから明らかになったシロイヌナズナ篩部分化     古田かおり(奈良先端大)
クライオ電子顕微鏡が解き明かす生体分子複合体の構造                重松秀樹(理研CLST)

 

理科啓蒙活動

理学部サマースクール

理学部サマースクール
「電子顕微鏡で視るミクロの世界」(高校1~3年生対象)開講を支援

2009年8月4日(火)

2010年8月3日(火)

2011年8月3日(水)

2012年8月7日(火)

2013年8月6日(火)

2015年8月5日(水)

2018年8月7日(火)

 

日本女子大学生涯学習センター(LLC)/BIC連携講座

日本女子大学生涯学習センター(LLC)/BIC連携講座
夏休み小学生科学体験教室
「ミクロの世界を見てみよう」

2009年8月8日(土)

2010年7月31日(土)

2011年8月6日(土)

2012年7月28日(土)

2013年8月3日(土)

 

家政学部通信教育過程夏期スクーリング

2009年8月27日(木)

家政学部通信教育過程夏期スクーリング「生命の科学(B)」への協力

 

第56回目白祭

2009年10月17日(土)、18日(日)

第56回目白祭「SPsrk」に参加した、数物科学科(物理)の「構造性発色」における電子顕微鏡試料作製および観察に協力

 

公開科学教室

公開科学教室
「顕微鏡でみる生き物」(附属豊明小学校5年生対象)開催

2009年12月3日(木)、4日(金)

2010年11月26日(金)

2011年11月25日(金)

2012年11月26日(月)

2013年12月6日(金)

2014年11月14日(金)

2015年11月19日(木)、20日(金)

2016年12月9日(金)

2017年11月8日(水)、10日(金)

2018年12月5日(水)~7日(金)

 

公開科学教室
「顕微鏡でみる生き物」(附属豊明幼稚園対象)開催

2009年2月14日(土)

2010年1月23日(土)

2011年2月19日(土)

2012年2月25日(土)

2013年1月12日(土)

2014年2月15日(土)

2015年3月7日(土)

2016年2月13日(土)

2017年2月25日(土)

 

日本女子大学物質生物縦の会 見学会

2011年12月3日(土)開催

日本女子大学物質生物縦の会見学会(日本女子大学物質生物縦の会主催、BIC共催)

 

文京区教育センター 子ども科学カレッジ

文京区教育センター 子ども科学カレッジ
文京区教育センター/日本女子大学バイオイメージングセンター(BIC)
「ミクロの世界をのぞいてみよう」開催

2012年5月26日(土)(第1回)

2013年6月1日(土)(第2回)

2014年8月25日(月)(第3回)

2015年7月4日(土)(第4回)

技術講習会

第4回IIRS(綜合画像研究支援)サイエンスカフェ

2009年6月13日(土)

第4回IIRS(綜合画像研究支援)サイエンスカフェ(IIRS主催、BIC共催)
「モロフォ蝶に学ぶ構造発光線維❛モルフォテックス❜」      広瀬治子(帝人(株))

 

第5回IIRS(綜合画像研究支援)セミナー

2009年6月13日(土)

第5回IIRS(綜合画像研究支援)セミナー(IIRS主催、BIC共催)
「電子顕微鏡で脂肪滴の謎に迫る」               藤本豊士(名古屋大学大学院)

 

技術セミナー

2009年8月24日(月)

技術セミナー(BIC主催、IIRS共催)
「New Dimension in Structural Biology」            Dr.Buruno Humbel

 

専門技術セミナー

2009年9月8日(火)

専門技術セミナー(IIRS主催、BIC共催)
「加圧凍結固定法の実際」                   北 重夫

 

専門技術講習会

2009年9月25日(金)

専門技術講習会(於:日本電子(株))
「JEM-1400およびトモグラフィー講習会」           西岡秀夫(日本電子(株))

 

第5回IIRS(綜合画像研究支援)サイエンスカフェ

2010年6月5日(土)

第5回IIRS(綜合画像研究支援)サイエンスカフェ(IIRS主催、BIC共催)
「植物の超❝美❞細構造を捉える」
  独立行政法人理化学研究所 植物科学研究センター       豊岡公徳

 

第6回IIRS(綜合画像研究支援)セミナー

2010年6月5日(土)

第6回IIRS(綜合画像研究支援)セミナー(IIRS主催、BIC共催)
「生殖細胞機能の可視化:精細胞分化から受精/初期胚発生まで」
  千葉大学大学院医学研究院 教授               年森清隆

 

第6回IIRS(綜合画像研究支援)サイエンスカフェ

2011年11月12日(土)

第6回IIRS(綜合画像研究支援)サイエンスカフェ(IIRS主催、BIC共催)
「アセチルコリン受容体のしくみに迫る!-構造解析から分子メカニズムの解明へ-」
  兵庫県立大学大学院 生命理学研究科 細胞構造学分野 教授
  独立行政法人理化学研究所 放射光科学総合研究センター     宮澤淳夫

 

第7回IIRS(綜合画像研究支援)セミナー

2011年11月12日(土)

第7回IIRS(綜合画像研究支援)セミナー(IIRS主催、BIC共催)
鼎談『電子顕微鏡による生物試料3D観察の夜明けから現在、そして将来』

講師 濱 清(岡崎国立共同研究機構 生理学研究所 名誉教授)
   和氣健二郎(ミノファーゲン株式会社 顧問、東京医科歯科大学 名誉教授)
司会 光岡 薫((独)産業技術総合研究所 タンパク構造情報解析研究チーム長)

 

第7回IIRS(綜合画像研究支援)サイエンスカフェ

2012年6月16日(土)

第7回IIRS(綜合画像研究支援)サイエンスカフェ(IIRS主催、BIC共催)
「イオン液体の電子顕微鏡応用」
 多持隆一郎(株式会社日立ハイテクノロジーズグローバルアプリケーションセンター長)

 

第8回IIRS(綜合画像研究支援)セミナー

2012年6月16日(土)

第8回IIRS(綜合画像研究支援)セミナー(IIRS主催、BIC共催)
「大気圧走査電子顕微鏡 JASM-6200」
 須賀三雄(日本電子株式会社 経営戦略室主査)

 

第9回IIRS(綜合画像研究支援)セミナー

2013年6月1日(土)

第9回IIRS(綜合画像研究支援)セミナー(IIRS主催、BIC共催、日本顕微鏡学会後援)
コンビ―ナー:岡部繁男(東京大学大学院医学系研究科)

Part1.第9回IIRSセミナー・サテライトワークショップ
超解像顕微鏡システム(G-STED+HyD)の見学

Part2.第9回IIRSセミナー(IIRS主催、BIC共催、日本顕微鏡学会後援)
講演1:「電子顕微鏡連続切片の再構成による大脳皮質抑制性神経細胞の特徴抽出」
     窪田芳之(生理学研究所)
講演2:「FCS・FCCSによる細胞内分子ダイナミズムの解明」
     金城政孝(北海道大学大学院先端生命科学研究院)
講演3:「共焦点顕微鏡 白色レーザー光源と超解像STED顕微鏡」
     伊集院敏(ライカマイクロシステムズ(株))
講演4:「電子顕微鏡、光学顕微鏡を用いたハイスループット・3Dイメージング」
     兼崎琢磨(カールツァイスマイクロスコピー(株))
総合討論

Part3.第10回アカデミックサロン